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一个单细胞亚群肯定是有多个特异性高表达量基因

可以看到,绝大部分亚群都是有三五个基因。而且第一次分群是通用规则的3大亚群的基因是固定的, 背诵下来后跑一下 可视化单细胞亚群的标记基因的5个方法的代码即可,详见以前我们做的投票:可视化单细胞亚群的标记基因的5个...

2022-03-03
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对单细胞亚群取子集后继续降维聚类分群该如何做

描述的很清楚,每个单细胞亚群细分后取子集的时候,仍然是需要UMI 的raw counts值,从代码的角度就是:

2022-03-03
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《Science》封面:流式细胞术里程碑式进展!免疫学和基因组学研究的一次革命

全球领先的医疗技术公司BDX今天宣布,与欧洲分子生物学实验室(EMBL)合作进行的一项研究,并发表在1月21日的《Science》杂志的封面故事,介绍了流式细胞术中的一项新的BD创新,该创新增加了荧光成像和基于图像的决策,以异常高...

2022-02-28
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低功耗设计 | always on cell

有些逻辑需要在关机期间保持活动状态,如Power Switch Cell、Retention Register Cells、Isolation Cells,他们就被称为Always-On Logic Cells。它可以不管voltage area的关断与否,一直保持常开的状态。...

2022-02-11
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【生信文献200篇】93 伊布替尼(ibrutinib)联合R-CHOP化疗对DLBCL基因亚型的影响

英文标题:Effect of ibrutinib with R-CHOP chemotherapy in genetic subtypes of DLBCL

2022-01-27
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python openpyxl 读写

1、载入: from openpyxl import load_workbook

2022-01-10
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你认为是双细胞人家说是全新细胞亚群

在朋友圈看到了一个单细胞文献快讯:杜克-新加坡国立大学医学院和新加坡科学技术局基因组研究所等机构的研究人员在 Cancer Discovery 期刊发表了题为:《Single-cell atlas of lineage states, tumor microenvironment a...

2021-12-27
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61-R可视化-9-对已有统计结果数据做统计分析绘图

比如这个结果,返回的就是95% 的置信区间。这里我们暂时不去看freqCI 函数算法本身是否正确。

2021-12-17
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肺癌样品里面的正常的上皮细胞是什么(单细胞CNS图表复现23)

我们在前面的教程:CNS图表复现09—上皮细胞可以区分为恶性与否 提到了五千多个上皮细胞里面只有三千七百左右是恶性细胞,那么一千七百多个的正常的上皮细胞是什么呢?而且前些天我们 比较了copykat和infercnv这两个从单细...

2021-12-16
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单细胞转录组揭示肺腺癌特有的肿瘤微环境

揭示两种不同的肺腺癌微环境模式,基于微环境提供额外的预后信息,预测潜在的目标细胞群用于治疗

2021-12-16
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