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让Single cell UMAP注释支棱起来

最近在画UMAP的时候发现有的时候细胞亚群的注释与点重合颜色上不是很搭配,同事提出让注释“支棱”起来,首先想到的是ggforce中的geom_mark_ellipse,实践中遇到一些问题(比如,ggforce会受outlier影响,看起来比较乱),于是有了这...

2021-09-15
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单细胞测序鉴定银屑病的致病细胞亚群

牛皮癣是一种IL-17 驱动的炎性皮肤病,自身免疫原诱导的CD8+T细胞被认为是主要的作用细胞。

2021-09-15
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【SIGIR 2021 最佳学生论文】图像文本检索的动态模态交互建模

本文分享一篇 SIGIR 2021 最佳学生论文『Dynamic Modality Interaction Modeling for Image-Text Retrieval』,图像文本检索的动态模态交互建模。

2021-09-03
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OSCA单细胞数据分析笔记14—Empty/Doublet droplet

现行主流的Droplet-based单细胞测序技术主要思路是一个磁珠捕获一个细胞置于油包水的腔室里完成添加标签、建库操作。但在磁珠捕获的过程会出现未捕获到细胞或者两个细胞的异常情况。这就需要我们在分析单细胞数据中...

2021-08-20
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LeetCode 0212 - Word Search II

Given a 2D board and a list of words from the dictionary, find all words in the board.

2021-08-11
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LeetCode 0329 - Longest Increasing Path in a Matrix

Given an integer matrix, find the length of the longest increasing path.

2021-08-11
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Illumina上机前处理及测序全网最全教程!

本教程主要针对16s这类文库,供参考使用。具体的操作流程还是以Illumina的官方文件为准。

2021-07-30
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单细胞文献你不整理,过后甚至会忘记自己曾经读过

该研究的实验设计很清晰,就是 5 个正常人加上13个患者 的 血液进行单细胞转录组 :

2021-07-29
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VBA实战技巧27:根据颜色汇总单元格数据

本文给出了一种根据单元格背景色汇总单元格数据的方法:使用VBA创建一个自定义函数来实现该目的。

2021-07-12
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使用R语言的Mfuzz包进行基因表达的时间趋势分析并划分聚类群

本篇简介一个R包,Mfuzz(http://mfuzz.sysbiolab.eu)。Mfuzz包最初是为处理基因表达或蛋白表达谱数据而开发的一种聚类方法,核心算法基于模糊c均值聚类(Fuzzy C-Means Clustering,FCM),用于在具有时间序列特征的转录组、蛋白质...

2021-07-12
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