chipBase收集来自GEO,ENCODE数据库中的chip_seq数据，通过对这些原始数据进行分析，致力于构建各种转录因子与非编码RNA, 蛋白编码基因之间的调控网络，网址如下...

Cistrome的目标是提供一个基因组顺式作用元件分析的综合性数据库，通过收集来自GEO,ENCODE等公共数据库中的chip_seq, DNase_seq, ATAC_seq 原始数据，采用统一的分析方法，用bwa比对参考基因组，然后采用macs2进行peak call...

ChIP-Atlas收集整理了SRA数据库中的大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了后续分析，将分析结果整理成在线服务并发布，方便检索与查询，网址如下...

简介：Ubuntu Cinnamon是一个新发行版，它在Ubuntu代码库的基础上利用Linux Mint的Cinnamon桌面环境。它的第一个稳定版本基于Ubuntu 19.10 Eoan Ermine。

强化学习代理，是一种通过奖励或惩罚机制逐步刺激目标实现的人工智能——它构成了自动驾驶汽车、灵巧机器人和药物发现系统的基础。但是因为它们倾向于探索不熟悉的状态，所以它们会很容易受到所谓的安全探索问题的影响，在...

FactorBook整合了ENCODE数据库中人和小鼠的chip_seq数据，以转录因子为中心，进行了转录因子motif分析, 与其他转录因子或者组蛋白修饰的关联分析，数据库网址如下...

ENCODE是Encyclopedia of DNA Elements的缩写，是由美国人类基因组研究中心NHGRI赞助的一项国际化的合作项目，通过整合DNA, RNA，蛋白质，表观修饰等多个层次的数据，旨在建立一个全面的人类基因组数据研究的数据库。...

将contorl对应的序列集合称之为negative sequences, 将另一组称之positive sequences,采用费舍尔精确检验分析motif在positive出现的次数是否比negative中出现的次数更多。...

对于de novo motif分析而言，我们只需要提供序列就可以了。由于peak的长度范围存在一定的波动，通常选取peak中心，即峰值两侧固定长度的序列用于下游的motif分析。...

这部分工具用于预测输入序列上的motif信息，支持DNA，RNA或者蛋白序列，对应的功能称之为de novo motif discovery,包含的工具列表如下