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Biological Psychiatry: 基于维度与类别的自闭症异质性混和分析模型

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2020-03-05
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单基因结合全基因组发6分SCI

各位小伙伴们大家好,这次给大家分享一篇2019年3月发表在EBioMedicine杂志上的,影响因子6.68的文献。题目是Integrative analysis of h-prune as a potential therapeutic target for hepatocellular carcinoma。文章主...

2020-03-04
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使用CCS序列数据改进宏基因组拼接效率和物种分类注释

DNA组装是用于研究微生物群落结构和功能的宏基因组流程中的核心方法学步骤。在这里,我们调查太平洋生物科学长期和高精度循环共识测序(CCS)的宏基因组项目的实用性。我们比较了PacBio CCS和Illumina HiSeq数据的应用和性...

2020-03-03
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深度学习预测RNA二级结构,蚂蚁金服提出端到端模型E2Efold

理解 RNA 二级结构的相关研究具有重要意义。二级结构是指 RNA 序列各个位置有氢健互补配对的碱基。RNA 的三维结构往往是在先形成的二级结构的框架上折叠而成的,所以知道二级结构就能够用来表征 RNA 结构、推断功能机...

2020-02-24
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Mol. Biol. Evol. | 中科院动物所揭示石山叶猴适应喀斯特环境的遗传机制

中国科学院动物研究所灵长类生态学研究组与德国灵长类研究中心等国内外多家科研机构合作,利用比较基因组、种群基因组及其细胞学功能实验,揭示了乌叶猴属中的石山叶猴种组物种适应喀斯特特殊生境的遗传机制,发现石山叶猴...

2020-01-16
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分享一本审稿快,国人友好型的3分杂志

《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》发表临床肿瘤学领域的文章,涵盖以下领域:致癌作用-病因、机制;分子生物学; 肿瘤治疗的最新进展;一般诊断;实验室诊断;诊断和实验病理学;肿瘤外科;和流行病学。...

2020-01-16
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chromosome-territories:染色质疆域简介

人类基因组大小在3G左右,这么多的DNA线性排列,完全展开其长度可以达到2米,而细胞直径是微米级别的,这意味着DNA在细胞核内肯定是高度折叠的。众所周知,结构决定功能,这样的空间结构势必对于生命体复杂的功能造成了影响。...

2019-12-19
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使用ROSE鉴定超级增强子

ROSE是最经典的超级增强子预测软件,由Richard A. Young大牛团队开发,源代码的网址如下

2019-12-19
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HEDD:增强子疾病相关数据库

增强子作为一种重要的基因组顺式作用元件,在转录调控中发挥重要作用,参与很多的生物学过程,当然也包括了疾病的发生与发展。

2019-12-19
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HiGlass:高度定制的Hi-C数据可视化应用

HiGlass是一个hi-C数据可视化的web应用,参考UCSC基因组浏览器和juicebox中数据的展示形式,运用D3.js等流行的可视化框架对数据进行展示,基于web技术提升了用户的交互体验,缺点就是需要搭建过程比较繁琐。网址如下...

2019-12-19
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