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copykat为什么没有infercnv直观呢

其实 copykat 仅仅是算法判别的时候不如人意,但是可视化的时候仍然是肉眼可以明显区分二倍体正常细胞和非整倍体的癌症细胞,所以我们想看看具体做什么改进,可以绕过这个bug,首选项我们把全部的上皮细胞按照病人进行了拆分...

2021-12-04
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深入浅出介绍聚类分析

聚类分析是生信分析中常用的工具,在转录组分析中经常用到。聚类分析将表达模式相似的基因聚类在一起,以基因集的形式进行后续分析,今天小编给大家介绍其相关原理。...

2021-10-15
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我以为热图只能画数值型数据,万万没想到...

今天在群里看到一个非常漂亮的热图,我以为是什么奇怪的新R包画的,转了一圈发现原来还是大名鼎鼎的ComplexHeatmap丫。今天的代码都是在作者写的书基础上探索学习的,书在:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-refer...

2021-02-19
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数据分析小技巧第七集:快速清洗、定位最关键特征

我正在按照下面施工计划往前推进,标记小红旗部分已经讲完,你可以从这里:施工专题已完成 60 篇 汇总 找到过往推送文章

2021-01-06
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这个Python热力图,十分精美!

热力图的x轴表示常见的水果,y轴表示月份,每个色块的颜色值代表销量,颜色越接近红色表示对应水果在对应月份的销量越大。

2020-10-23
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R-ggTimeSeries | ggplot2: 热力日历图

我们平常的日历也可以当作可视化工具,适用于显示不同时间段,以及活动事件的组织情况。时间段通常以不同单位显示,例如日、周、月和年。今天我们最常用的日历形式是公历,每个月份的月历由7个垂直列组成(代表每周7天),如图所示...

2020-09-10
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Python骚操作:一行代码实现探索性数据分析

在使用数据前,我们首先要做的是观察数据,包括查看数据的类型、数据的范围、数据的分布等。dataprep.eda是个非常不错的工具,它可以帮你快速生成数据概览。dataprep.eda包含的一些智能特性:...

2020-08-30
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绘图代码|10种绘制热图方法,你想要的全都有!

热图是生信分析中最常见的可视化数据的方法,它具有丰富的色彩变化,并且能生动饱满的进行信息表达。比如可视化基因表达、显著性P值等数据。R 在可视化方面也提供了一系列功能强大、覆盖全面的函数和工具包,今天小编就总...

2020-08-24
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R语言画热图时图例(legend)过多超出画图边界

但是如果添加多组注释信息的话,他的图例是从上到下依次排列,如果太多图例就会超过绘图边界,比如

2020-05-14
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circos 中的pattern是做什么用的

在官网提供的配置文件示例中,经常会见到pattern这个参数。这个参数的作用和fill_color类似,都用于指定填充的样式,只不过fill_color使用颜色进行填充,pattern则用点和线进行填充。...

2020-05-09
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