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adespatial:分解beta多样性的另一种选择

adespatial这个包功能十分强大,如还可以进行向前筛选(forward.sel)。但是注意forward.sel只能用于RDA,而vegan中的ordistep可用于RDA和CCA。变量筛选之前也写过:MRM中进行变量筛选...

2020-06-05
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rdaenvpart过程探索

最近赖江山老师发布了一个R包:原创R包:rdaenvpart(层次分割获取RDA和CCA单解释变量的贡献) http://wap.sciencenet.cn/home.php?mod=space&

2020-06-01
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segRDA: 分段冗余分析

Title: segRDA: An R package for performing piecewise redundancy analysis

2020-06-01
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一些R代码学习笔记

可用rarefy得到结果后在ggplot里自己画。核心是设定一个步长,这些步长都用rarefy函数进行重抽,再组合到一起即可。

2020-06-01
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R语言可视化STRING分析的蛋白互作网络(PPI)~报错解决

net<-graph_from_data_frame(d=links,vertices=nodes,directed = T)

2020-05-29
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R-三种做PCA函数的差异:princomp,prcomp及rda

做PCA的函数有很多,但是一直没有搞清楚他们的差别。正好最近有看到一篇公众号在说这个事情,我顺便也总结一下。

2020-05-29
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什么是好的R包

我发现写作这个事情也非常遵循楞次定律,上学期一旦开始了越写越停不下来,但是过春节停一段时间后,越不写越难以重新开始。整理了不少东西可以写作,但是每次都被懒癌打败,不知不觉又一个多月没更了。...

2020-05-29
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笔记 | GWAS 操作流程4-5:LM模型+数值+因子+PCA协变量

第一列为FID 第二列为ID 第三列以后为协变量(注意,只能是数字,不能是字符!)

2020-05-29
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笔记 | GWAS 操作流程4-3:LM模型+因子协变量

第一列为FID 第二列为ID 第三列以后为协变量(注意,只能是数字,不能是字符!)

2020-05-29
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[预训练语言模型专题] XLNet:公平一战!多项任务效果超越BERT

感谢清华大学自然语言处理实验室对预训练语言模型架构的梳理,我们将沿此脉络前行,探索预训练语言模型的前沿技术,红框中为已介绍的文章,绿框中为本期介绍的XLNet,欢迎大家留言讨论交流。...

2020-05-27
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