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采用igraph包分析网络数据

对于网络的可视化和数据挖掘,有很多图形界面的软件可供选择,比如cytoscape, gephi 等等,这些软件使用方便,操作简单,功能的强大,但是同时也有着一个缺点,就是无法自动处理,只能通过人工点击鼠标来操作,对于大批量数据的分析而...

2020-05-08
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如何利用matlab高效处理NC文件?

vardata = ncread(source,varname,start,count,stride)

2020-05-08
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R语言也可以进行ATAC数据的完整分析啦!

个人认为,R语言有两个强项,统计和绘图。在生物信息数据分析中,R语言更多时候是发挥一个科学计算和可视化的作用。当然,R语言的功能远不止于此,不仅可以作为脚本语言,解决统计分析和可视化的”小”问题,也可以编写一套完整pip...

2020-05-07
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R语言之可视化(30)扫地僧easystats(1)

see包是一个R语言可视化工具包,它能为使用者提供漂亮的、出版级的图像展示。 本文中主要介绍see包使用的主要函数:

2020-05-04
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CIBERSORT肿瘤免疫微环境分析,一文就搞定

免疫治疗是如何工作的呢?其主要通过激活人体本身的免疫系统,依靠自身的免疫机能杀灭癌细胞。目前已在多种肿瘤如黑色素瘤,非小细胞肺癌、肾癌和前列腺癌等实体瘤的治疗中展示出了强大的抗肿瘤活性,多个肿瘤免疫治疗药物已...

2020-04-30
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如何用R语言从网上读取多样格式数据

生活中,我们面临着各种各样的数据:比如你的成绩单,比如公司的财务报表,比如朋友圈的一些状态,比如微信里的一段语音……我们生活的大数据时代的一个重要特征便是数据的多样化(variety)。...

2020-04-29
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如何用R语言从网上读取多样格式数据

生活中,我们面临着各种各样的数据:比如你的成绩单,比如公司的财务报表,比如朋友圈的一些状态,比如微信里的一段语音……我们生活的大数据时代的一个重要特征便是数据的多样化(variety)。也许你期待的数据是这样的:...

2020-04-29
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用R语言对上海市链家二手房数据分析

via : https://mp.weixin.qq.com/s/DS4fFs0-rLD0UPkdTwQ5k

2020-04-29
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留言整理~ggplot2实现一幅自己叫不上来名字的图

自己之前只用过pheatmap这个包做简单的热图,没有用到过ann_colors这个参数。

2020-04-27
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学徒作业-两个基因突变联合看生存效应

前面我已经把一百多位优秀本科生带入了生物信息学的大门,接下来五年该大家奉献自己的博士成果了。如果大家感兴趣秀本科生活动, 已经带领了近100名优秀本科生了解生物信息学相关毕业设计:这120万我就不要了,送给500名优秀...

2020-04-27
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