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时序过关:平稳检验

时序是用时间线串联的一维的数据,时序每一个时间变量对于一个唯一的值带了的问题是:随机变量对应的样本是唯一。

2022-04-27
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pandas速成笔记(4)-数据图表

DateFrame自带的plot虽然能画图,但是如果希望能控制更灵活,比如:设置title的字体大小,x轴的标签不希望横着放(或旋转指定角度)等,还可以直接调用plt底层的方法...

2022-04-27
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forestploter: 分组创建具有置信区间的多列森林图

与其他绘制森林图的包相比,forestploter将森林图视为表格,元素按行和列对齐。可以调整森林图中显示的内容和方式,并且可以分组多列显示置信区间。森林图的布局由所提供的数据集决定。...

2022-04-14
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kmer 估计基因组大小

要想估计基因组的大小,也就是整条基因组的长度,我们把这个值设为大 G。那么测序的所有碱基数可以计算出来,将所有 reads 的碱基加起来就可以,为大 S。用所有碱基数除以每个碱基的平均覆盖深度 D,碱基总数除以测序深度,那么...

2022-04-07
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QQ图和曼哈顿图是嘛意思?

GWAS分析,QQ图和曼哈顿图是标配,可是这两个图具体是什么意思?怎么判断好坏,且听我一一道来。

2022-04-06
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同时展现两种数据的正确姿势 -- 双坐标轴来了(R语言)

当我们想同时展示两种数据,如销售量(千/月)和增长率(百分比)的变化情况,由于两组数据的数量级差别非常大,如果在一个y轴上展示则较小数量级的一组几乎无波动变化,此时可以绘制双坐标轴的图形,设置两个y轴,每个y轴都有自己的刻度...

2022-03-29
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KMunicate--绘制严谨且个性化的生存曲线!

KM法即乘积极限法(product-limit method),是现在生存分析最常用的方法,是由Kaplan和Meier于1958年提出,因此称Kaplan-Meier法,通常简称KM法。KM法是这样估计生存曲线:首先计算出活过一定时期的病人再活过下一时期的概率(即生...

2022-03-29
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qqboxplot--实现Q-Q plot和箱型图的整合!

箱形图(Box-plot)又称为盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。它主要用于反映原始数据分布的特征,还可以进行多组数据分布特征的比较。QQplot也就是Quantile-Quantile Plots。是通过比较两个概率...

2022-03-29
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半图绘制,加倍美观!

许多数据的可视化形式都是对称的,例如箱型图、散点图、小提琴图等。由于显示信息的空间有限,可以通过将几何图形切成两半并添加其他几何图形来更好地利用空间。...

2022-03-29
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VennDetail--可视化和提取多数据集交集细节

韦恩图用于展示在不同集合之间的数学或逻辑联系,尤其适合用来表示集合(或)类之间的“大致关系”。

2022-03-29
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