一致性聚类(Consensus Clustering)是一个能够确定数据集(微阵列基因表达)中可能聚类的数量和成员的方法。这种方法在癌症基因组学研究中广泛普及,用于发现新的疾病的分子亚型。...
前面我们介绍了一个对有害同义突变预测的方法PrDSM,可以发现,在对模型的分析中,大量的使用ROC对模型进行评估,今天我们就来介绍一下ROC的相关内容和两种ROC绘图方法:pROC、plotROC、ggROC和ROCR。...
小提琴图是帮助研究人员可视化数据的强大工具,尤其是在分析的质量检查和探索部分,小提琴图比箱线图更灵活地绘制变化。
正如之前介绍的一样,plot绘图包括scatter, line, histogram, heatmap等绘图模式。今天小编从scatter散点图开始介绍plot的绘图内容。
上文介绍了scatter plot绘图,相信大家对plot模块有了一定的了解。今天小编将介绍line plot 的绘图内容。
当一个序列遵循随机游走模型时,就说它是非平稳的。我们可以通过对时间序列进行一阶差分来对其进行平稳化,这将产生一个平稳序列,即零均值白噪声序列。例如,股票的股价遵循随机游走模型,收益序列(价格序列的差分)将遵循白噪声...
绘制分类或回归树的基本方法的 rpart() 函数只是调用 plot。然而,总的来说,结果并不漂亮。事实证明,一段时间以来,有一种更好的方法来绘制 rpart() 树。...
并且做了一个简单的可视化,见:CellPhoneDB的单细胞通讯结果的可视化之气泡图,差不多让大家理解了所谓的细胞通讯, 就是在两个不同单细胞亚群里面,各自高表达受体配体基因对里面的一个。比如CD74_MIF 和 C5AR1_RPS19 这两...
山峦图,英文名叫做ridge plot,其本质上是密度图(density plot),其实中文并没有统一的称呼,但是由于其外貌高低不平,形似山川,一般称呼其为“山峦图”。山峦图的用法与小提琴图、箱形图相似,主要用于可视化数据的分布情况,而外...
Molcular Profile Cox Analysis输入一个你想要的基因,比如RAC3,`Select Measure forplot可以设置OS,PFI,DSS和DFI`,然后点上方的搜索