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使用R语言随机波动模型SV处理时间序列中的随机波动率

采样函数svsample期望其输入数据y是数字矢量,而没有任何缺失值(NA),如果提供其他任何内容,则会引发错误。在y包含零的情况下,发出警告,并在进行辅助混合物采样之前,将大小为sd(y)/ 10000的小偏移常数添加到平方收益上。...

2020-08-07
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基因芯片数据质量控制

>source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

2020-08-06
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森林图+QQ plot

> csize <- data.frame(mean = c(NA,0.5585,0.6628,0.7794,0.7458,0.7564),lower = c(NA,0.4849,0.5867,0.5856,0.6734,0.6886),upper = c(NA,0.6319,0.7335,0.8123,0.7965,...

2020-08-06
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R语言-多重比较

前面提到ANOVA的F检验能够知道五种疗法有显著性差异,但是不知道哪一种疗法和其他疗法不同,多重比较可以解决这个问题。TukeyHSD()函数提供对各组均值差异的成对比较。但是TukeyHSD()函数与HH包存在不兼容性的问题,在调用Tuke...

2020-08-06
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R-forestplot包| HR结果绘制森林图

上一篇简单的介绍了COX生存分析结果绘制森林图Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化,本文将介绍根据数据集合的基本信息以及点估计值(置信区间区间)的结果直接绘制森林图的方法。...

2020-08-06
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ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P value(P值),值越大差异越显著。得名原因也许是因为结果图像火山吧...

2020-08-06
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绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图

在得到数据之后,我们经常会用到维恩图来展示各个数据集之间的重叠关系。本文简单的介绍R语言中的VennDiagram包绘制数据集的维恩图。

2020-08-06
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R|UpSet-集合可视化

介绍一个R包UpSetR,专门用来集合可视化,当多集合的韦恩图不容易看的时候,就是它大展身手的时候了。

2020-08-06
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R|plotly

plotly包:是一个基于浏览器的交互式图表库,建立在开源的JavaScript图表库plotly.js上,plotly包利用函数plot_ly函数绘制交互图。本文简单介绍几种常见图表的绘制方式,点图、线图及箱线图。...

2020-08-06
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R语言入门之评估假设检验的条件

在传统的假设检验过程中,我们常常假定模型的误差项是符合正态分布且同方差的。对于这样的假设是否真的成立,通常情况下我们可以使用诊断图来进行判断,但在这里我将和大家介绍如何使用其它方法去检查这两个条件是否同时满...

2020-08-06
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