小站VIP群里有中标标书的摘要，不过大家使用的并不全面站长挑选几个研究热点的摘要，本期的主题是RNA甲基化。RNA甲基化m6A-1*RNA腺嘌呤甲基化(m6A)调控是RNA表观遗传学重要研究内容，亦是生命科学新的研究热点。m6A作为一...

嵌合RNA是包含两个独立基因的外显子杂交的转录物。传统观点认为嵌合RNA是由染色体重排引起的基因融合而来。这些典型的嵌合RNA被描述为具有癌症特异性表达模式和/或作为癌基因产物。然而，得益于深度测序技术的发展，一类...

对嵌合 RNA进行实验验证是十分重要的。第一个原因是我们需要确认嵌合RNA的存在并消除嵌合RNA验证中出现的假阳性，这些假阳性可能是在软件预测时受到了其他外界因素的影响导致。为了验证候选嵌合RNA的存在，将与RNA序列分...

小站VIP群里有中标标书的摘要，不过大家使用的并不全面站长挑选几个研究热点的摘要，本期的主题是RNA甲基化。RNA甲基化m6A-1*RNA腺嘌呤甲基化(m6A)调控是RNA表观遗传学重要研究内容，亦是生命科学新的研究热点。m6A作为一...

下面这个流程是下载这个网站公开数据的方法，使用到的工具是TCGAbiolinks(https://github.com/BioinformaticsFMRP/TCGAbiolinks)，

其中一个数据集是2020发在NC的肺癌单细胞文章：《Single-cell RNA sequencing demonstrates the molecular and cellular reprogramming of metastatic lung adenocarcinoma》，是44个肺癌病人的58个10x技术的......

本文[1]将介绍 SeqKit ：用于 FASTA/Q 文件操作的跨平台和超快工具包，后续提供了一些常用的示例

现在有了高质量的细胞，可以继续工作流程。最终，希望对细胞进行聚类并识别不同的潜在细胞类型，但是在那之前需要完成几个步骤。下面的工作流程示意图中的绿色框对应于QC 后采取的步骤，共同构成了聚类工作流程。...

TCGA在去年更新之后提供了Count、TPM、FPKM三种格式的mRNA表达量数据，同时提供了ensembl gene ID、基因名、基因类型，因此有必要更新一下数据了。

2022年12月19日，Nature杂志发表新闻文章The science events to watch for in 2023，整理了2023年值得关注的科学事件。