上一期的教程给大家讲解了批量对TCGA中的基因进行生存分析的第一步。主要内容为：如何通过cBioportal去下载TCGA中的数据和患者的表型数据，然后通过R语言做了一个生存分析的KM图。本期，带领大家认识一下一次性进行成百上...
然后学员有任意需求，任意位置添加任意数字，这样写会比较麻烦，每次都有手动判断向量长度，范围等等，因为她是初学者，所以不可能会无限R包和函数，我这里简单演示一下：...
最近发现了一个专门收集整理了肿瘤转移数据的数据库工具——HCMDB，网址：http://hcmdb.i-sanger.com/index。该工具由华东师范大学的董东教授于2017年发表于著名的《Nucleic Acids Research》，影响因子11.147分。...
ES5的变化search_type=count和scan都移除了count可以用size=0代替GET /my_index/_search{ "size": 0, "aggs": {
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事情起源于，某个吃了很多汉堡王一起学习的日子，技能树一众学徒一起学习从GEO数据挖掘到limma差异分析等等等。
GEO数据下载####有了这句，GEO下载会顺畅一些options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' )一键清除所有变量rm(list=
卫星黑客很多人感觉很酷，电视的媒体会报道一些有关火箭、卫星方面的东西，在我们的印象中，卫星属于人类的高科技。那么从黑客角度出发，入侵卫星就成了很多人梦寐以求甚至仰望、崇拜的地位，这个是情有可原。但卫星安全问题真...
以GSE111229为例方法一 1 下载并保存GEO数据 下载有error可以：设置镜像、访问外国网站、rm(list=ls（）)一下重试…library(GEOquery)GSE_name = 'GSE111229'options( 'download.file.method.GEOqu......
比较芯片领域 Affymetrix 公司一家独大，可惜现在也被赛默飞收购了，但其实我开始从事生物信息学的时候已经是ngs技术的天下了，只不过数据处理到发表文章通常相隔3年左右的时间。...
