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玩转基因组浏览器之利用IGV查找motif结合位点

motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能,在转录因子的chip_seq, m6A_seq等落雨都有广泛应用,之前也写了很多的文章来介绍motif

2020-05-07
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Seurat包的findmarkers函数只能根据划分好的亚群进行差异分析吗

虽然是免费的, 但是学员关于课程的提问,我还是会尽我所能帮忙的。当然,受限于时间和精力,只能是挑选重点和普适性的有价值的问题,比如其中一个问题是:...

2020-04-28
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对表型数据框进行去冗余

很明显,有些信息是冗余的,有些是有效信息可以用来分组,但是表型记录太多,看起来会混淆,所以需要去除那些冗余信息,就是在所有样本里面表型记录都一致的列。...

2020-03-30
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看初学者如何理解RNA-seq的count矩阵

我布置了一个作业,让大家可以尝试把cox可以火山图为什么gsea结果不行 这个里面的数据集 GSE101668 ,里面的表达矩阵,进行热图可视化,很多同学完成了作业,我随机挑选其中一个学徒的优秀笔记跟大家分享!...

2020-03-10
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自噬相关基因模型在非小细胞肺癌中的预后意义

各位小伙伴们大家好,这次给大家分享的文献是Prognostic implications of autophagy-associated gene signatures in non-small cell lung cancer,2019年12月发表在Aging杂志上,影响因子5.515。文章通过对自噬相关基因表...

2020-03-04
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关于install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")安装问题

请教了生信技能树老师,也尝试了下载AnnoProbe包到本地后安装,结果还是失败。绝望到极点,然后查看了一些以往的命令,发现经常出现:

2020-02-21
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nature杂志给你的生物信息学数据处理11个小技巧

nature杂志的TECHNOLOGY FEATURE 栏目在13 JANUARY 2020发表了一个有趣的小短文:Eleven tips for working with large data sets,副标题是:Big data are difficult to handle. These tips and tri......

2020-02-20
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根据感兴趣基因看肝癌免疫微环境的T细胞亚群差异

在单细胞水平探究肝癌免疫微环境研究最早而且出名的就是北大张泽明教授团队发表在Cell. 2017 Jun 的文章:Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing.,他们测序策略是:Here...

2020-02-20
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按照列筛选数据框不容易那么按照行就容易吗

开始正式教程分享之前,先公布一个好消息,腾讯云的排行榜显示我们生信技能树是平台全国排名第123位有影响力的自媒体,还有一个证书:

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2020-02-20
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推力达1牛,我国首款牛级霍尔推力器完成点火试验

近日,航天集团六院801所成功研制出了我国首款20千瓦大功率霍尔推力器,并完成点火试验,实现了我国自研推力器推力从毫牛级向牛级的跨越。

geo
2020-02-14
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