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R科研绘图调色板—ggsci

ggsci是R中的一个包,提供了一系列颜色给ggplot2调色。里面包括了一些知名杂志期刊或者软件(甚至是知名科幻电影、动画等)的经典配色风格,对于科研绘图是相当有帮助的。下边介绍一下这个包的用法和内容,如果想要自己查看说...

2020-04-01
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过滤不合格细胞和基因(数据质控很重要)

现在一起看看拿到表达矩阵后有一个很重要的质控过程,就是根据一些阈值来过滤不合格细胞和基因。、细胞的不合格很容易理解, 可能是那个细胞检测到的基因数量太少,或者太多,也许是那个细胞的文库大小异常,都是需要谨慎考虑...

2020-03-30
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简单将ggplot多个图排列在一起

ClonEvol: clonal ordering and visualization in cancer sequencing文献里面CloneEvol包里面boxplot.r函数

2020-03-08
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对因子合成的思考

最近思考了一些关于因子合成的东西。多因子的体系里,我们希望通过多个因子的叠加来提高模型整体对于未来收益率的预测能力。如何确定叠加后的因子一定会效果更好?...

2019-09-24
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第一次看到如此原始的R绘图代码

上面的67个循环,代码就构建了67个长度为2千万的向量,对这两千万的向量画boxplot,一个向量内存约200多M,R语言本身如此低效,怪不得我都没有出图,肯定是内存溢出,挂掉了。...

2019-09-06
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matplotlib 箱线图

箱线图,是指—种描述数据分布的统计图,是表述数据的第一四分位数、中位数、第三四分位数与异常值(离群值)的一种图形方法。它也可以粗略地看出数据是否具有对称性,分布的分散程度等信息,特别是可用于对多组样本的比较。...

2019-08-14
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浅谈一款进阶软件R的实际运用

发现这款软件在小样本,常见的临床问题中可以快速的解决我们大部分问题,其简单操作界面以及菜单式操作方式成为很多人选择它的理由。但是,当我们遇到某些大数据,或者复杂统计运算时,如果还拿SPSS作为自己的救命稻草,那可能就...

2019-05-13
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统计学10讲之示例数据

本来有statquest珠玉在前,我实在是提不起笔和勇气写统计学专题,但是最近直播单细胞转录组数据分析发现这系列知识点实在是太重要,而我的习惯是,讲不清楚的知识点不认为自己掌握了,所以还是尝试着介绍一波。...

2019-05-08
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