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Bioinformatics | XRRpred:根据蛋白质序列精确预测晶体结构质量

今天给大家介绍的是Sina Ghadermarzi等人发表在Bioinformatics上的一篇文章“XRRpred: accurate predictor of crystal structure quality from protein sequence”。目前,用x射线晶体学产生的蛋白质结构的质量差异很...

2021-09-10
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stPlus:利用scRNA-seq数据中的信息精确增强空间转录组学分析

空间转录组学技术的最新进展进一步使细胞的基因表达谱和空间组织图谱同时实现。在这些技术中,基于成像的方法可以提供更高的空间分辨率,但它们受到成像基因数量少或基因检测灵敏度低的限制。尽管已经提出了几种增强空间...

2021-08-19
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LDM及permanovaFL的使用

背景:Bioinformatics:线性分解模型LDM检验微生物差异Microbiome: 组内PERMANOVA和LDM提高了微生物组数据分析的效率本文对ldm和permanovaFL函数做简要介绍。# https://github.com/yijuanhu/LDM# 从github上下载后本地安...

2021-07-30
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R绘制甲基化和表达谱联合分析热图

随着时代的发展,单一研究转录组、蛋白代谢、甲基化等已经难以满足研究者越来越高的研究期望,大家更多地期望联合多种数据进行多组学联合分析。那么这时候,一种好的展示结果的方式无疑会为发表高分文章增光添彩。...

2020-08-06
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RTK:针对大数据的稀释曲线

Link: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5870771/

2020-06-01
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如何成为顶级生物信息学家

前几天去南京参加两年一度的全国大会CCBSB2014,今年是第六届,见到许多熟识的前辈和老朋友,也结识了不少新朋友。相比于两年前在哈尔滨开的第五届大会,参会人数又多了100多。连大会特邀报告算上,总共76位学者做口头报告,其中...

2020-04-14
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