由于课题需要下载single cell raw data 进行后续分析，但是NCBI SRA 文件分割后只有一个FASTQ文件，只能从ENA上下载BAM 文件，使用Cell ranger bamtofastq 转为fastq文件再进行比对。开启了慢慢长ERROR路...

背景 预测得到一个物种的全部基因之后，接下来自然而然的问题就出现了。这些基因都有哪些功能呢?这就需要进行基因功能注释。基因功能注释就是将待查基因与已知数据库进行比对，如果比对上则认为二者...

在生物学和基础医学领域，研究细胞类型的分化和细胞状态的转化是非常重要的一环，它可能与疾病的发生发展有着重要且密切的联系。单细胞转录组测序可以保留单个细胞的转录组信息，且由于细胞分化是一个连续的过程，所以单细胞...

详见此链接：https://www.jianshu.com/p/34c23dbd9dc1

当有几类亚群同属于某类细胞时，比如CD4+ T细胞和CD8+ T细胞均属于T细胞，想要将他们合并在一起时，可以使用此代码。

空间转录组学技术的最新进展进一步使细胞的基因表达谱和空间组织图谱同时实现。在这些技术中，基于成像的方法可以提供更高的空间分辨率，但它们受到成像基因数量少或基因检测灵敏度低的限制。尽管已经提出了几种增强空间...

随着单细胞测序技术的成熟和测序成本的不断下降，产生了越来越多的单细胞数据。在整合来自多个批次的单细胞数据时，批次效应校正至关重要。

近日，由南通大学信息科学技术学院、南通大学智能信息技术研究中心的王理教授为通讯作者在Briefing in Bioinformatics杂志发表了其团队最新研究成果：该作者提出了“S2DV”方法，这是一个用于对小分子药物进行表示学习的方...

2021年11月8日，美国俄亥俄州立大学（Ohio State University）区健辉（Kin Fai Au）研究组在Nature Biotechnology在线发表综述论文Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications，该文章系统全......

今天给大家介绍的是Sina Ghadermarzi等人发表在Bioinformatics上的一篇文章“XRRpred: accurate predictor of crystal structure quality from protein sequence”。目前，用x射线晶体学产生的蛋白质结构的质量差异很...