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WES,WGS等DNA测序数据找变异流程服务

肿瘤或者家系的WES,WGS等DNA测序样品的fastq数据,需要比对到参考基因组并且找变异并且注释,我们仅仅是收取一个计算机资源的费用,800-8000元人民币(根据样品数量不同收费不一样)即可,并且提供全套代码。不管是公共数据集还是...

2021-10-21
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Linux字符截取命令-cut

cut是一个选取命令,。一般来说,选取信息通常是针对“行”来进行分析的,并不是整篇信息分析的。

2021-08-16
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[993]Linux查看文件指定行数内容

tail 和 head 加上 -n参数后 都代表输出到指定行数,tail是指定行数到结尾,head是开头到指定行数

2021-06-01
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openstack安装(4)

sed -i 's#SELINUX=enforcing#SELINUX=disabled#g' /etc/sysconfig/selinux

2021-05-06
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Linux下,通过cut命令提取对应的列内容【Linux】

-d ' ' , -d参数表示用什么分隔,这里表示用空格分隔(记住这里-d只支持单个字符分隔,也就是-d 'a'可以,-d 'ab'不可以)

2020-11-13
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Linux 查找当前目录下所有包含指定内容的文件

总结:sed -i "s/查找字符/替换字符/g" grep 查找字符 -rl 目录路径

2020-07-27
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Linux-批量替换文件内容

比如大量空行,对内容做批量修改sed(正则) 更擅长对行进行处理文字替换 只输出到终端 Str-》String内容没有变更确认替换 -i替换转义 全文替换 /最后+g错误示范,只...

2020-07-07
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「Shell」结合 sed 与 mv 批量修改文件名

所以最好把前面的内容去掉,sed 可以使用模式匹配进行文本修改,而 mv 可以重命名文件,我们结合两者试试。首先用单个文件测试修改方式是否正确:

2020-07-02
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qiime2+biom+qiime1获得16S物种丰度

我们知道,不管是16S等扩增子测序,还是宏基因组,最后最重要的结果,就是物种的丰度情况了,qiime2给出的16S丰度结果是一个计数,对于许多软件来说这是可用的,那么如果我们想获得一个直接的百分比数据应该怎样做呢?...

2020-06-23
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imp导入 替换表空间

imp导入时,表空间和导出时是一样的, 但是现在要改, 而 imp tablespaces=new_tablespace 无效.

sed
2020-06-18
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