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简~剪~减~见~系统发育树和OTU对齐

在计算系统发育多样性及随机性(βMNTD)等指标的时候,同时需要OTU文件及系统进化树的文件。

2020-12-02
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scVelo

需要的文件:由R里面对Seurat对象的数据导出的 1.velocyto pipeline 跑出来的loom文件 2.细胞名字文件 3.细胞属于的类群

2020-11-27
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病原微生物扩增子数据分析实战(二):fastp软件进行质量控制

当前主流测序平台的数据存储格式无外乎两种,FASTQ(Illumina, MGI),BAM(Life Ion Torrent,PacBio),对于 BAM 文件,通常也需要先转换成 FASTQ 文件后再进行质控处理。...

2020-11-19
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病原微生物扩增子数据分析实战(三):vsearch软件鉴定物种组成

病原微生物基因检测的两大核心任务是物种组成和功能组成的鉴定,而扩增子测序的首要目的是找到致病的细菌或者病毒,即鉴定物种组成。

2020-11-19
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两分钟带你彻底明白机器学习中的过采样和欠采样是什么意思?

是不同数据有不同定义,可分为空间/非空间数据。空间数据指空间上邻近的数据含有相关信息,可以用信号处理滤波的方法提取出这些相关信号,比如图像,声音。非空间数据指数据不是空间上的邻居,不能提取空间信息,比如身高,姓名,工...

2020-11-19
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音视频封装:MP4结构概述和分析工具

前面已经讲了好几种封装格式包括了TS、FLV、RTP等。现在用几篇文章讲解下MP4,这种封装格式设计思路和前面都不太一样,其应用范围最广、灵活性最高、跨平台最好,兼容性最强。带来的负面影响就是格式本身比较复杂,特别是在...

2020-11-12
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数学--数论-- HDU -- 2854 Central Meridian Number (暴力打表)

A Central Meridian (ACM) Number N is a positive integer satisfies that given two positive integers A and B, and among A, B and N, we have N | ((A^2)*B+1) Then ...

2020-11-06
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数学--数论--HDU 1792 A New Change Problem (GCD+打表找规律)

Problem Description Now given two kinds of coins A and B,which satisfy that GCD(A,B)=1.Here you can assume that there are enough coins for both kinds.Please ca...

2020-11-06
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数学--数论--HDU 12151七夕节

七夕节Problem Description 七夕节那天,月老来到数字王国,他在城门上贴了一张告示,并且和数字王国的人们说:“你们想知道你们的另一半是谁吗?那就按照告示上的方法去找吧!” 人们纷...

2020-11-06
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数学--数论--HDU 2136(素数筛选法)

Everybody knows any number can be combined by the prime number. Now, your task is telling me what position of the largest prime factor. The position of prime ...

2020-11-06
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