在R中做数据处理时，数据导入导出是常见操作，对于导入而言，如果源数据保存在多个文件中，那么导入后首先就需要进行合并操作。

ChAMP 提供了完整的分析甲基化芯片的pipieline, 从数据导入到差异分析和下游的基因功能分析。首先来看下数据导入部分通过champ.load 函数导入数据， 用法如下...

经过预处理之后的数据，就可以进行差异分析了。对于甲基化芯片而言，有两个方面的差异分析

用[n+1]维数组表示n维坐标的方法叫齐次坐标法(Homogenous coordinate)。

monocle做拟时序分析首先要构建CDS需要3个矩阵：expr.matrix、pd、fd，其次将Seurat中的对象转换为monocle识别的对象。然后选择想要做拟时序依据的基因就可以了,如果已知开始和结束的细胞，将过程开始时收集的细胞与结束时...

本教程是翻译自 Orchestrating Single-Cell Analysis with Bioconductor(https://osca.bioconductor.org/), 由于前三章是序言和软件介绍等无关紧要的内容，所以我们从第四章数据基础框架开始...

每个人的时间精力有限，必须优先阅读相关文献，开设这个栏目也是希望为大家推荐高质量的单细胞相关文献。如果大家对单细胞转录组感兴趣可以关注一下，哪怕每天只学一点点，积土成山，积水成渊。...

如果在矩阵中，多数的元素并没有资料，称此矩阵为稀疏矩阵（sparse matrix）， 由于矩阵在程式中常使用二维阵列表示，二维阵列的大小与使用的记忆体空间成正比，如果多数的元素没有资料，则会造成记忆体空间的浪费，为 此，必须设计稀疏...

[ sigma_{11}=3,quadsigma_{12} = sigma_{13} = 1, quad sigma_{22} = sigma_{33} = 0, quadsigma_{23} = 2 ] 求

原因：matrix = [array] * 3操作中，只是创建3个指向array的引用，所以一旦array改变，matrix中3个list也会随之改变。