2.circular color系统:可以控制色调,亮度和饱和度 hls色彩,是RGB值的简单转换。
seaborn中实现scatterplot的主要参数 seaborn.catplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, row=None, col=None, col_wrap=None, order=None, hue_order=None, row_order=None, ...
做单细胞测序的时候,我们往往用到不同时期或者不同测序平台的数据,即使是同样的细胞类型,也可能完全不能聚类到一个类群中,如下所示,这两个数据是不同时期做的同一个细胞,几乎没有交集,因此,我们分析的时候需要去除批次效应...
seaborn.violinplot基本参数为: violinplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, order=None, hue_order=None, bw='scott', cut=2, scale='area', scale_hue=True, gridsize=...
计算一下所有细胞的counts分布情况,发现counts差距比较大,因此需要normalize
在做等位基因(allele)的研究中,其中一个重要的步骤就是去除比对偏差。 众所周知,人是二倍体生物,在染色体同样位置会有一对allele,一般情况下是纯合子(homozygous)状态;有时候其中一个allele发生变异(可以理解为一个SNP,寡...
有时候看到paper中有的图,大图中嵌套小图:image.png这种图在基础作图plot和ggplot2中都可以实现:plot实现#构造两组数x <- rnorm(100) y <- r
在生物学上,经常会遇到找control和treat的差异基因或者任意两个或者两个以上处理条件下,最差异的变化,比如我有这样一个数据,几千个细胞分为处理过的和没处理过的,然后通过拍照记录了他们的形态大小等几十个特征,我想知道...
因为顺序变了,要是想保持原来每个样本对应的颜色的话,也要改变小提琴的颜色.如: 原始的样子
整理了一些vim的set用法:1.显示隐藏分隔符set list 可以看到分隔符为制表符。2.取消显示隐藏制表符set nolist3. 显示行号set nu4.取消显示行号set