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STAR:转录组数据比对工具简介

STAR是一款RNA_seq数据专用的比对软件,比对速度非常快,最大的优势是灵敏度高,GATK推荐采用STAR比对,然后进行下游的SNP分析。软件的源代码保存在github上,地址如下...

2020-05-08
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详解GFF转换为GTF文件

存储基因和转录本的结构信息,gtf和gff3两种格式都可以。在实际分析时,会需要转换两种格式。比如,NCBI 只提供了GFF格式的下载文件,我们需要转换成GTF文件之后再使用。...

2020-05-08
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从UCSC下载基因组的GTF文件

从UCSC下载基因组的GTF文件有两种方式,一种是利用table browser 浏览器,另外一种是通过FTP服务。

2020-05-08
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Pfam:蛋白质家族数据库简介

在蛋白质分子中,包含多个结构特异并且功能区里的区域,这些区域称之为domain, domain 可以看做蛋白质功能的基本单位,蛋白质的功能由包含的多个domain共同决定。研究domain, 可以更好的研究蛋白质功能。...

2020-05-08
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GOA:Gene Ontology注释信息数据库

GOA全称Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI构建的一个GO注释信息的数据库。官网如下

2020-05-08
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ALLPATHS-LG基因组组装软件简介

ALLPATHS-LG 是由Broad Institiute研究所发明的一款基因组组装软件,不论是细菌/真菌等小型基因组,还是动植物等大型基因组的组装,它都能够胜任。官网如下:...

2020-05-08
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【新手出发】从搭虚拟机开始,一步一步在CentOS上跑起来.Net Core程序

微软6月26号发布core 1.0版本后,园子里关于这方面的文章就更加火爆了,不管是从文章数量还是大家互动的热情来看,绝对是最热门的技术NO.1。我从去年底开始接触.net core到现在也大半年了,一直停留在浏览各种帖子上,偶尔新建...

2020-05-08
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信息搜集-Github文件泄露搜索语法

site:Github.com smtp admin@%.com  (webmaster、root、help、service,And so on..)

2020-05-06
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非常重要的地址转换(NAT)技术,必须好好捋一遍!

RFC1631文档描述了:NAT是将IP数据报的报头中的IP地址转换为另一个IP地质大过程。在实际应用中,NAT主要用于实现私有网络访问外部网络的功能。这种通过允许使用少量的公有IP地址代表多数私有IP地址的方式将有助于减缓可...

2020-05-06
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【- Light 计划 -】新建了一台Linux云服务器我该干嘛

引子 Light计划我思考良久,觉得可以着手了。第一束光便照进---服务器: 服务器对于编程者爱好者而言就像剑之于男人的浪漫 关于Linux云服务器的入门,该走的坑带你走一遍。 记住一点:服务器就是一台永远开机,没有屏幕的本...

2020-04-30
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