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cellchat-(1)单数据集的细胞通讯分析

接下来需要选择配体受体数据库,cellchat的数据库是基于文献手动生成的,包含的物种和数量为:

2023-05-20
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cellchat0-包安装和数据准备

需要准备一个标注好细胞类型的单细胞数据,这里选择seurat官方的pbmc3k数据:

2023-05-10
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生物医学研究和临床应用中单细胞RNA-seq数据分析指南

单细胞RNA测序(scRNA-seq)在生物医学研究中的应用,提高了对疾病发病机制的认识,并为新的诊断和治疗策略提供了有价值的见解。随着包括临床样本在内的高通量scRNA-seq数据的扩大,对这些大量数据的分析已经成为进入这一领...

2022-12-08
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探索肿瘤微环境中的细胞互作

在多细胞生物中,细胞通过与其他细胞的交流来协调从早期发育到组织和器官成熟的各个方面。当它们不能正常交流时,疾病就会发生。在互作过程中,由细胞表达的配体结合到同源受体上,同源受体通过接收细胞和信号识别从配体细胞...

2022-10-27
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单细胞转录组之使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析

细胞通讯分析可以提供细胞亚群互调控的信息,细胞间的调控主要是通过受体配体结合来实现信号传递的。

2022-07-13
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