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BPCells package 安装问题

一百万细胞或更多细胞的单细胞转录组分析在数据整合方面非常消耗电脑内存,我在单位32G 内存的iMac上跑,经常会出现R session abortion。然后发现Seurat官方给出了v5,即更新版的。...

2023-11-10
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单细胞转录组学轨迹分析解析2-Slingshot代码解析

通过上节对Slingshot文献的基本讲解,对这个拟时序的分析方法有了基本的了解,作者也公布了流程的代码,并分享在https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/slingshot/inst/doc/vignette.html上。...

2023-11-07
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单细胞转录组学轨迹分析解析1-Slingshot

在单细胞转录组中,比较经典的分析内容:单细胞拟时序分析(轨迹分析),主要为了对复杂的细胞亚群进行异质研究,主要应用于干细胞及其后代,来绘制从多种祖细胞到完全分化细胞的进展情况。目前已经有了多种方法进行研究,今天主要介...

2023-11-06
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