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过了很久之后才想起来继续整理单细胞测序的标准分析流程。书接上回单细胞测序—标准流程代码(2) — 标记基因与细胞注释,这篇帖子主要关注的是富集分析。...

2024-09-04
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单细胞irGSEA分析:整合多种富集分析方式的R包

irGSEA整合了多种基于单个细胞表达等级的富集分析方法(AUCell、UCell、singscore、ssGSEA、JASMINE和Viper),并通过秩聚合算法(robust rank aggregation, RRA)对差异分析的结果进行评估,筛选出在这种几种方法中表现出相...

2024-08-16
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