最新 最热

R语言plot画图par(mfrow=c(1,2))实现一页多图

R语言plot()函数画图时,想将几幅图画在同一页上,使用到par()函数定义一页多图。

2024-01-30
0

vissE--提供不同的基因集富集分析方法!

通常,基因集富集分析的结果(例如使用 limma::fry、singscore 或 GSEA)由一长串基因集组成。然后生物学家必须搜索这些列表,以确定新出现的主题来解释改变的生物过程。这项任务可能是劳动密集型的,因此需要解决方案来总结来...

2022-03-29
0

igraph包——绘制网络图

本文是复杂网络课的一个小作业,主要学习如何导入图数据以及如何利用igraph包绘制网络图。

2021-04-09
0

scRNA plus||单细胞结合传统测序技术之路

单细胞即是在单个细胞水平上来考察组织生物学信息,在单细胞时代之前,人们获得组织生物学信息有两个层面:组织水平和分子水平,单细胞技术弥补了这两者之间的鸿沟。众所周知,细胞是生物的基本构成单位,不管之前的组织水平还是...

2021-03-25
0

R语言复杂网络分析:聚类(社区检测)和可视化

原文链接:http://tecdat.cn/?p=18770 为了用R来处理网络数据,我们使用婚礼数据集。> nflo=network(flo,directed=FALSE)> plot(nf

2020-12-30
0

R:qgraph初探

上文Hilldiv: 便捷的计算及可视化Hill number提到了可以直接可视化qgraph。第一次见,此文简要介绍一下。

2020-05-29
0

R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)

SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指标的衡量来评价网络结构稳定性、集中趋势等。主要有中心度以及中心势两大类指标。

2019-05-27
0

关系网络理论︱细讲中介中心性(Betweeness Centrality)

中介中心性(Betweeness Centrality),又叫中间中心性,中间性,居间中心性等等。以下是学者们对中介中心性的解释。 中介中心性主要是由美国社会学家林顿·弗里曼(Freeman,1979)教授提出来的一个概念,它测量的是一个点在...

2019-05-26
0

一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的启示。这么好的知识,当然希望和大家分享,故约稿陈博士在“宏基因组...

2019-05-09
0

igraph软件包创建图和网络(创建邻接矩阵)

igraph 是一个独立的库,底层是 C,上层有 Python 和 R 接口,主要做图和网络方面的计算,附带绘图功能。

2019-02-14
0