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X86 vs ARM 架构同台竞技: 生物大数据大规模并行计算(如何将WGS全基因组计算成本降到1美元)

基因组序列分析是生命科学和医疗保健行业领域的重要组成部分,是众多技术突破的关键。随着生命数字化时代的来临,为了解决大数据带来的速度与费用问题,在云计算平台进行流程的分析及计算是目前较流行的方案。然而大部分用...

2022-11-09
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Sentieon DNAscope白皮书:做胚系遗传变异检测,比GATK更好的选择

DNAscope模块,是Sentieon软件的一个精准高效的胚系变异检测模块。其在GATK基础上优化了核心算法,在继承GATK成熟且完整的BAM预处理流程的同时,引入机器学习基因分型模型。相比于GATK金标准而言,在大幅降低计算成本的情况...

2022-11-09
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Sentieon软件发布202112.06版本更新

Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型,在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10...

2022-11-09
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Hap-Eval:Sentieon团队开发的开源结构变异SV准确率评估工具

Sentieon开发的Hap-eval准确率评估工具在设计之初就考虑到了复杂以及重复的基因组区域,采用了基于单倍型拼接序列的矩阵比较模式,兼容包括PacBio和ONT在内的主流三代长读长测序数据。另外值得一提的是,Hap-eval基于pytho...

2022-11-09
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