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液滴型单细胞测序技术比较(二)

三种液滴型方法采用相似的技术生成液滴,采用barcode标记细胞,应用UMI进行偏好校正。但它们在beads的 、barcode的设计、cDNA扩增等不同。

2022-01-18
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umijs 框架加载mp4视频背景

1、放到public 文件家里 2、vedio 标签加载src 直接下./ 在root 目录加载即可

2021-12-10
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scATAC-seq2: scATAC-seq技术原理

之前的推文中,我们主要对scATAC-seq研究的科学问题作了简单的介绍。这篇推文主要介绍scATAC-seq的技术原理和发展历程。下面这张图选自SnapATAC这个R包的作者Rongxin Fang的github上分享的内容(https://github.com/r3fa...

2021-10-09
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单细胞转录组基本概念(一)

普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞或一个器官混合到一起去提取RNA,获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值。单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA,然后建库测序,获得是是单个细胞...

2021-05-27
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单细胞分析十八般武艺9:DoubletFinder

单细胞测序期望每个barcode标签下只有一个真实的细胞,但是实际数据中会有两个或多个细胞共用一个barcode的情况,业内称之为doublets或multiplets(后面统称为doublets)。Doublets形成的原因主要是高通量单细胞测序一般使用...

2021-05-18
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对10X单细胞reads进行随机抽样

此功能使用样本中的信息通过指定的道具对每个分子的读数进行下采样。然后,它基于具有非零读取计数的分子构造一个UMI计数矩阵。目的是消除技术噪声中的差异,这些差异可以按批次进行聚类,如downsampleMatrix中所述。...

umi
2021-03-25
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单细胞测序技术原理

2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。

2020-11-03
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React倒计时功能实现——解耦通用

React倒计时功能实现——解耦通用需求分析需求 在某个页面中需要有一个倒计时的功能,倒计时 5 s,5s钟后跳转到新的界面分析首先是实现倒计时功能其次是实现在每倒计时 1 s后页面上要执行 倒计时秒数变化的功能最后是实...

2020-09-18
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scNT-Seq ||区分新生成的RNAs的单细胞测序技术

单细胞RNA测序提供了整个转录组的表达,但常见的scRNAseq不能区分新生成RNA与之前存在的RNA。在这里,我们介绍了单细胞新转录物标记测序(scNT-Seq),一种用于大规模并行分析同一细胞中新转录和已有RNA的方法。常用的区分新旧...

2020-08-26
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10X Genomics VDJ测序

前面给大家简单的介绍了什么是免疫组库。今天小编给大家介绍一种研究免疫组库的方法。

2020-08-06
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