当前的单细胞测序主要采用 illumina 测序平台进行测序，一般为双末端测序，测序完成之后首先需要对 illumina 测序数据进行质控过滤，过滤条件与其他分析类似。需要注意的是，虽然单细胞测序也是双末端测序，但是 reads1 中通常...
单细胞测序主要包括以下四个步骤。其中非常关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选，这是决定单细胞检测成本和通量的关键步骤。
单细胞转录组测序通常是基于二代测序平台，具有相对较低的成本和高通量的优势。由于二代测序建库过程需要对cDNA进行打断，无法同时获得细胞标签和全长转录组数据，所以对单细胞转录本的变化知之甚少。而三代测序可以获得全...
放射治疗是恶性肿瘤最有效的治疗方法之一。通过诱导 DNA 双链断裂，电离辐射 (IR) 利用具有包含 DNA 损伤修复系统的肿瘤细胞来控制肿瘤生长。组织病理学特征（如分化、增殖和组织特异性病理学）和肿瘤微环境因素（如缺氧和炎...
空间转录组学被认为是时空分子图像的重要组成部分，可以将分子信息与临床图像联系起来。高质量的人类样本制备和处理将确保从临床空间转录组生成准确可靠的信息。...
在单细胞RNA表达数据中，通常我们会观察到大量的零值，也称为drop-out现象。常规的单细胞分析中，会在预处理中通过归一化或插补进行处理。这里小编给大家介绍一篇关于处理drop-out的文章，结果展示了drop-out与细胞异质性的...
自从2009 年首篇关于scRNA-seq的文章发表以来，这项技术正在被广泛的采用。随着测序平台商业化的迅速发展和相关生物信息学方法的不断成熟，带来了很多生物医学领域新的发现。上期我们简单的介绍了scRNA-seq的背景和数据...
描述的很清楚，每个单细胞亚群细分后取子集的时候，仍然是需要UMI 的raw counts值，从代码的角度就是：
Umi 的路由跳转可以在配置文件中配置，但如果需要跳转的 path 路径不固定，就比较麻烦了。
