本文并没有翻译core task中的所有内容,而是选择了常用task进行翻译。查看原文请猛击这里。
PAM是一组安全机制的模块,系统管理员可以用来轻易地调整服务程序的认证方式,而不必对应用程序进行任何修改。
这样的文件很明显没办法给我们跑单细胞转录组流程,看了看原文:《Single-cell RNA sequencing reveals B cell–related molecular biomarkers for Alzheimer’s disease》,其实在《单细胞天地》有它的介绍:单细胞测序揭示...
如果你查看它示例数据里面的表达矩阵文件test_counts.txt 可以看到 ensemble数据库的ID,所以推测CellPhoneDB works only with human ensembl ids,假如你的表达矩阵去其它物种,或者其它ID形式先需要转换一下哈,可以使用同...
就是4个文本文件,其中 means.txt 和 pvalues.txt以及, significant_means.txt都是300行,而且都是90多列,说明这3个文件是相互关联的。下面我们来一一解读:
如果你对这些文件的理解还不够,继续看 :CellPhoneDB的单细胞通讯结果的理解
因为教程跨越了不同时间周期,软件更新,数据集的特异性,导致很多小伙伴follow不同系统的教程会得到不一样的报错。
并且做了一个简单的可视化,见:CellPhoneDB的单细胞通讯结果的可视化之气泡图,差不多让大家理解了所谓的细胞通讯, 就是在两个不同单细胞亚群里面,各自高表达受体配体基因对里面的一个。比如CD74_MIF 和 C5AR1_RPS19 这两...
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4.把加密后的内容放在txt里,再放到公网网站上例:http://example.com/1.txt