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R语言把otu表格的绝对丰度转换为相对丰度

基本的思路是:先把otu表格宽格式转换成长格式,然后根据样本分组求和,生成一个新的列,然后用绝对丰度值除以求和列得到相对丰度,最后再转换为长格式...

2024-06-18
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云雨图进阶绘制法-环状云雨图

腾讯云开发者社区是腾讯云官方开发者社区,致力于打造开发者的技术分享型社区。提供专栏,问答,沙龙等产品和服务,汇聚海量精品云计算使用和开发经验,致力于帮助开发者快速成长与发展,营造开放的云计算技术生态圈。...

2024-05-28
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dplyr中的行操作

在tidyverse中,整洁数据一般都是每一行是一个观测,每一列是一个变量,基本上所有操作都是基于整洁的数据进行的,都是对某列做什么操作。但有时候我们也需要对某行做一些操作,dplyr中现在提供了rowwise()函数快速执行对行的...

2022-11-15
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R数据科学整洁之道:使用 dplyr 处理关系数据

有人喜欢用 Excel 的 vlookup 函数来处理。但对于生信人来说,这显然不够优雅,因为我们有更好的办法。

2022-11-11
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tidyverse

Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合,里面包括了readr,tidyr, dplyr,purrr,tibble,stringr, forcats,ggplot2 等包。https://github.com/tidyverse/...

2022-10-25
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使用R优雅的批量计算相关性

❝本节来介绍如何通过R来批量做相关性分析,将通过两个小例子来进行介绍,1个for循环与另一个tidyverse体系;加载R包library(tidyverse)library(magrittr)library(ggstatsplot)案例一导入数据Bats <- read.csv(file = "Bat...

2022-09-21
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R优雅的进行统计分析(1) T_test

❝本节来介绍如何使用R语言来做数据统计分析,通过「rstati」包进行t-test,完全使用tidyverse体系进行数据清洗及可视化❞安装并加载R包package.list=c("tidyverse","rstatix","ggtext")for (package in package.list) {...

2022-09-21
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多个性状的BLUP计算综合育种值

最近有老师问如何计算多个育种值的综合育种值,因为选择育种时,需要考虑多个性状,而这些性状单位不一样,怎么合并计算?

2022-07-27
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「R」连接两个数据集的各种 join

本文来自 stack overflow 上的一个帖子base与data.table适用

2022-01-21
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81-R编程14-重复值的两种特殊处理

在[[15-R编程01-基本数据类型及其操作之向量]] 中,我就已经简单的提过,可以通过unique 或duplicated 非常暴力的实现去重。

2022-01-04
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