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clusterProfiler到底有多难安装呢

但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析),而且内置了很多数据库,好用的函数。...

2020-07-30
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回答公众号留言的2个关于相关性分析的问题

https://www.bilibili.com/video/BV1Ne41147eR

2020-07-28
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使用R语言获得16S物种丰度

还是获得16S物种丰度得老问题,最近在一台新机器上安装qiime1,发现有报错,对于这种停止维护的软件,也是正常现象吧,于是想别的办法解决,恰巧最近读R几本R语言的入门书,发现prop.table()这个函数是可以实现相关功能的,于是学习...

2020-07-27
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都说lncRNA只有部分具有polyA尾结构,请证明

但是慢慢的科研热点转到了lncRNA,虽然lncRNA只有部分具有polyA尾结构,但也意味着公共数据库里面海量的mRNA-seq表达矩阵里面,都是可以提取到lncRNA部分,新的分析图表就出来了。在很多综述或者教程都可以看到对lncRNA的这...

2020-07-24
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R语言 马赛克图

注意:mosaicplot和mosaic绘制马赛克图是基于多(二维以上)列联表。

2020-07-23
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魔改npm私有仓库 | Verdaccio教程

好久没分享前端技术了,今天推荐一个开源软件:Verdaccio,它是一个私有npm仓库。npm是一个基于http的协议,用来存放软件包并且维护版本和依赖,利用http提供的url路径、动词啥的来对软件包进行增删改查。所以Verdaccio这款软...

2020-07-23
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2020 年 7 月编程语言排行榜

TIOBE 2020 年 7 月份的编程语言排行榜已经公布,官方的标题是:R 语言的排名达到了历史最高位。

2020-07-22
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ggplot2火山图展示RNAseq差异表达分析结果

ggpubr包做火山图https://rpkgs.datanovia.com/ggpubr/reference/diff_express.html#examples

2020-07-22
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把你的shiny网页工具部署在云服务器

我们课题组有一份油菜的核心种质资源,前几年经重测序之后已经发表了。但是课题组后面很多的项目都基于这份核心种质资源,实验室成员常常需要检索分析某些基因的特定SNP,所以我在自学了一段时间的Shiny之后就尝试着搭建了...

2020-07-21
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Go 垃圾回收

Garbage Collection( GC )也就是垃圾回收到底是什么?内存空间是有限的,诸如变量等需要分配内存才能存储数据,而当这个变量不再使用的时候就需要释放它占用的内存,这就是垃圾回收。...

2020-07-20
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