今天我们接着讲绘制热图时候的一个小技巧，如何显示样本的类型。我们经常还在文章中看到类似下面这样的热图。会在列的上方用颜色标注样本的类型。这样可以一目了然的看出找到的差异表达基因能否很好的将不同类型的样本...

这张图在传统的相关性散点图的基础上还多了一个直方图，来展示该变量的分布情况。今天我们就来带大家来重现这样的图。

也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+gplots的配色方案来绘制热图

也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+gplots的配色方案来绘制热图

今天我们接着来聊heatmap这个函数绘制热图，这次我们使用gplots这个R包里面的配色方案

其实每一张热图后面都对应一个表达矩阵。如上图所示，每一行是一个基因，每一列是一个样本。每一个小的色块，就是这个基因在这个样本中的表达量。只是这里用颜色的深浅来表示基因表达值的高低而已，颜色越红，表达值越高。颜色...

RColorBrewer包提供了3类调色板，用户只需要指定配色方案的名称，就可以用包中的brewer.pal()函数生成颜色。这3类包括：

colorRamp()和colorRampPalette()都可用于建立调色板。通过传入希望得到颜色渐变，如蓝、紫，colorRamp()和colorRampPalette都会返回一个函数。二者返回的函数区别为：colorRamp()返回的函数像grey()一样，输入的参数为[0,1]...

在上一期☞R语言中的颜色(一)中，我给大家介绍了R中的颜色以及自带的一些配色方案。这一期我给大家介绍一下gplots这个R包中的配色方案。

做单细胞数据分析的时候，我们经常会从公共数据库，或者从别人那里得到一个seurat对象，有些人可能想从这个seurat对象中提取原始的表达矩阵，自己再从头分析一遍。那么今天小编就讲讲怎么实现，我们以SeuratData这个包里面自带...