FBA的第一步是用数学方法表示代谢反应。这种表示的核心特征是以数值矩阵的形式列出每个反应的化学计量系数。这些化学计量对代谢物通过网络的流动施加了限制。诸如此类的限制是FBA的核心。...

无意间发现一个好玩的R包(blastula)，R也可以用来自动发送邮件，之前都是用python。这样用R处理一些事情后日志就可以直接通过R发送。

接下来需要选择配体受体数据库，cellchat的数据库是基于文献手动生成的，包含的物种和数量为：

使用样本偏度（skewness）进行某一对象（方法-基因集对）偏向0或者偏向1的判断

通过加载optparse包进行参数设置，这种方法类似与python中argparse方法设置参数，如果不是简单的一两个参数推荐这种方法调用参数。

x1 = read.csv("C:/Users/win10/Desktop/x.csv")

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初级统计函数 max() ，min() ， mean() ， median() ，var()方差 ， sd()标准差 ， sum()总和， length(x) # 长度（x中元素的个数）， unique(x) #去重复（第一次出现不为重复，第二次出现为重复），duplicated(x)#检查重复值 ， ta......

"To ascertain whether a pre-existing subset of endoderm progenitors were responsible for generating endoderm cells in EZH2-/- cultures, we used flow cytometry t...

using函数是我写在$HOME/.Rprofile中的函数，因此每次打开R就能使用。