今天给大家介绍一个GWAS分析过程中的一个重要的环节eQTL（表达数量性状位点）分析。eQTL指的是染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域，其mRNA/蛋白质的表达水平量与数量性状成比例关系，通俗点讲就是把基因表达...

了解测序的同志们应该都知道有很多格式的原始文件，同时在转化过程中很是麻烦。今天我们给大家介绍一个R包，它可以进行对原始数据的读取，同时并且可以导出时进行转化格式。...

我们今天给大家介绍一个通过人类肿瘤的进化条件所选择的事件介绍。其只设计了Linux下的版本所以我们如果需要安装在windows下还是需要利用devtools进行编译安装。当然，其依赖的包还是需要我们自己去安装。那么我们看下...

那么在R语言中如何绘制这样的图形呢，今天给大家介绍在R语言中绘制棒棒糖的图，有人也直接叫它棒棒糖图。在trackViewer中可以实现其绘制。

大家对热图应该都不陌生，但是混合的复杂热图在我们的应用中并不是太多见。今天给大家介绍一个绘制复杂热图的R包ComplexHeatmap。

拷贝数分析大家都不陌生， 其可能和表型变异紧密关联，同时在物种的演化和发展中发挥着重要作用。今天我们来介绍一个在R语言环境下运行的拷贝数分析包cn.mops.。...

对于DNA数据和蛋白质数据的分析和可视化一般大家都不会考虑R语言，但是还是有学者开发了在R语言的DNA和蛋白质数据的分析和可视化。那就是R包seqinr。这个包包含的函数数量也是我见过的最多的了，当然啦，人外有人，天外有天，...

大家对ROC曲线都很熟悉，从方法的特异性和灵敏度出发反应一个方法的准确度。但是，在临床的应用中，往往仅通过以上标准得到的准确度是不可靠的。故早在2006年纪念斯隆-凯特琳癌症中心AndrewVickers博士等人研究出另外一个...

生物进化树基本理论指出所有的生物都可以追溯到共同的祖先，生物的产生和分化就像树一样地生长、分叉，以树的形式来表示生物之间的进化关系是非常自然的事。可以用树中的各个分支点代表一类生物起源的相对时间，两个分支点...

学习药化的同志们应该都了解化合物分子的特征描述有很多计算软件，今天我们来给大家展示下在R语言中如何实现分子特征描述的计算。主要以MACCS分子指纹的实现作为案例。...