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R语言实现UMAP降维模型

UMAP算法被认为是与t-SNE相似的原理,都是将高维概率分布映射到低维空间的算法,从而做到降维的效果。主要基于流形理论和拓扑算法的理论,对高维数据进行降维,从而形成其他分类模型的输入特征。...

2019-07-31
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R语言实现网状meta分析

随着循证医学的发展,各种新型的Meta分析方法被研发,网状Meta分析也就是一种新型产物,那么怎么定义网状meta分析呢。可以简单做个定义那就是在探究同一条件多种干预措施可以确定干预策的排序。其中最主流的是基于Bayesian...

2019-07-31
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R语言高级数据结构data.table

对于data.frame大家应该很熟悉,它可以存储不同数据类型的向量数据。今天给大家介绍一个升级版的data.frame,其不仅可以存储不同数据类型还可以进行多列的并行运算。包的安装我们就不再赘述了(install.packages(“data.ta...

2019-07-31
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R语言实现多种图像格式导出再编辑

不知道大家在为自己的文章绘图的时候总觉得不是那么完美。老是想自己手动改改,可是呢,AI呀PS呀又是一塌糊涂。今天我就为大家介绍一个可以讲R语言绘制的图形直接导入PPT/word并且可以进行修改的R包export。...

2019-07-31
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R语言中也可以帮你解方程

方程的求根大家应该在高中就已深入骨髓,今天给大家介绍下在R语言中如何实现方程的求根以及方程中参数的确定。我们需要借助R包rootSolve开始我们的教程。包的安装就不再赘述了。直接进入主题,在此包中求根函数涉及以下...

2019-07-31
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R语言实现表格的可视化渲染

不知道大家有没有发现在很多网页中会有很多漂亮的表格,那么今天我们就来看下在R语言中如何实现网页交互式表格的绘制。首先,我们来看下实现这个功能的R包“formattable”。它的安装可以直接install.packages(“formatta...

2019-07-31
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R语言如何让数据更论文化

大家在给文章作图的时候是不是会感到很痛苦,不知道该怎么调色,也对图形样式的选择感到迷茫。今天给大家介绍一个具有强大功能的绘图R包ggpubr。它整合了目前基本流行的图形样式,包括箱线图、气泡图、柱状图、散点图、密...

2019-07-31
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R语言绘制网络图

大家应该熟悉网络调控在基因关系之间的重要性,今天我们为大家展示在R语言中如何实现网络图的绘制。绘制的包有很多,我们今天不一一介绍从我个人角度推荐igrapgh。因为它基于Java可以介入各平台使用。...

2019-07-31
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R语言实现CHIP-seq数据分析

ChIP-Seq是将ChIP(Chromatin Immuno precipitation)与二代测序技术相结合的技术,高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区域。ChIP也称为结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通...

2019-07-31
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R语言图形交互基础一

从今天开始我们开启R语言的交互图形设计征程,今天主要是初识shiny这个交互的R包。

2019-07-31
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