最新 最热

【科研猫】生存分析的正确姿势(1)视频+R代码分享

生存分析很重要,如何高效地对两万多个基因批量做生存分析?今天,猎豹师兄带领大家,正确姿势做生存分析,快速锁定目标基因。

2019-09-24
0

挖掘GEO速成SCI文章系列教程(3)-R语言基础

另外,最近几期有关挖掘GEO速成SCI文章的系列教程中,先是讲解了一些基本概念、数据库的构成,以及如何从GEO中快速锁定自己想要的目标数据。在获得数据之后,后续的分析过程同样也要借助R语言来实现。...

2019-09-24
0

终极篇:3分钟搞定GO/KEGG功能富集分析-气泡图

干货预警:3分钟搞定GO/KEGG功能富集分析(2),给大家详细讲解了DAVID网站的使用,通过分步操作,带领大家学习了使用DAVID工具来进行GO和KEGG分析。今天,我们重点讲解如何将DAVID中的功能富集的结果转换成正式的Figure,有请小猎豹...

2019-09-24
0

大咖聊“生信”—生物信息入门必备

这几年生物信息学(Bioinformatics,下文简称生信)的迅猛发展席卷科研领域,越来越多的科研工作者认识到生物信息的重要性,部分实验室甚至开出高价招聘专职的生物信息分析人员。越来越多的研究生为了老板的需求或者自己的发展...

2019-09-24
0

R包ggseqlogo |绘制序列分析图

在生物信息分析中,经常会做序列分析图(sequence logo),这里的序列指的是核苷酸(DNA/RNA链中)或氨基酸(在蛋白质序列中)。sequence logo图是用来可视化一段序列某个位点的保守性,据根提供的序列组展示位点信息。常用于描述...

2019-09-23
0

生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)

现在回过头来看,很多教程已然过时,当然并不是说的知识点过时,其实linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的linux教学视频,也不会觉得尴尬。主要是其中一些资源链接,一些小技巧都过时了,比如...

2019-09-17
0

一个R语言中操纵矢量空间数据的标准化工具—sf

摘要 Simple features是一种在计算机中编码矢量空间数据(点、线、面等)的标准化方法。sf包在R语言中引入了simple features对象,它基本具备和sp、rgeos、rgdal一样的矢量空间数据处理能力。本文主要描述此包的基本功能,其...

2019-09-17
0

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)

对于组学数据的分析和展示来说,maftools算是一个宝藏“R包”,可用于MAF格式的组学数据的汇总,分析和可视化展示。

2019-09-16
0

R语言实现单细胞测序的表达矩阵复原

首先要下载所需要的示例数据,下载地址:https://storage.googleapis.com/linnarsson-lab-www-blobs/blobs/cortex/expression_mRNA_17-Aug-2014.txt

2019-09-12
0

IEEE 2019编程语言排行榜出炉:趋势开源职位需求Python都是第一

IEEE Spectrum 刚刚发布了第六届编程语言排行榜。在新的排名方式下,Python 再次名列第一,而且与第二名的差距正在加大。名列后几位的分别是 Java、C 语言、C++和 R 语言。...

2019-09-11
0