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【访谈】大神自学编程的经验之谈

编程,programming,无时无刻不在改变我们的生活,从衣食住行,到科学前沿,各种编程语言层出不穷。在生命科学领域,越来越多的同行开始自学程序语言,周围的同事每天都在上演着从医生到实验员到程序员的身份来回转变。以前一天的...

2019-10-28
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ggThemeAssist|鼠标调整主题,并返回代码

R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节需要写大量代码,而且还要反复修改、预览,很是费时费力。

2019-10-28
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文章测序数据下载碰到的问题的小总结(南京站学员分享)

全国巡讲南京站过去还不到一周,学员们课后练习都很拼,微信群答疑对话一不留神就几百条了,爱学习的你是最美丽的!

2019-10-25
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多个探针对应同一个基因取最大值的代码进化历史

最近全国巡讲的学员又问到了多个探针对应同一个基因取最大值类似的问题,我们的斯老师找到了我三年前的博客:多个探针对应一个基因,取平均值或者最大值 我看到里面的留言很有趣:...

2019-10-25
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R&Python Data Science 系列:数据处理(1)

数据科学主要以统计学、机器学习、数据可视化等,使用工具将原始数据转换为认识和知识(可视化或者模型),主要研究内容包括数据导入、数据转换、可视化、构建模型等。当前R语言和Python是两门最重要的数据科学工具,本系列主...

2019-10-24
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ComplexHeatmap |理解绘图逻辑绘制热图

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源。

2019-10-21
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R语言之可视化(27)ggplot2绘制线图

本文主要表达如何使用ggplot2绘制线图。线图一般表达的目的是:某个因变量随着自变量改变而变化的趋势。因变量可以为数值型变量或者分类变量。可供选的函数有: geom_line(), geom_step(), geom_path() 举例来说:因变量...

2019-10-20
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R语言实现肿瘤细胞计数

今天给大家介绍一个病理图像中肿瘤细胞计数的图像处理包CRImage。此包对R语言的版本要求比较高,必须是不低于3.6版本的R语言才可以安装。安装需要的前期准备:...

2019-10-17
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线性混合模型系列二:模型假定

1. 混合线性模型公式和假定混合线性模型的公式和假定,一般认为随机因子和残差是符合正态分布的,随机因子可以相关(比如系谱关系,SNP构建G矩阵关系),用A矩阵或者G矩阵表示,残差是独立同分布的,矩阵结构一般是单位矩阵。...

2019-10-17
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