为了生成风格比较统一的图片，让博客的整体风格看起来比较统一，而不是很乱的感觉，自己动手写了一款简单的图像生成小工具，看下博客之前和现在的对比图。...

cat /boot/grub2/grub.cfg |grep menuentry

monocle做拟时序分析首先要构建CDS需要3个矩阵：expr.matrix、pd、fd，其次将Seurat中的对象转换为monocle识别的对象。然后选择想要做拟时序依据的基因就可以了,如果已知开始和结束的细胞，将过程开始时收集的细胞与结束时...

Plotly是个交互式可视化的第三方库，可以实现R语言的交互可视化，用法与ggplot差不多，默认的颜色比ggplot好看很多，本文简单介绍一下Plotly的应用。

记录一下看过的文献。 这篇文章主要讲述了原始的三胚层在原肠胚形成时需要远端和近端精确到表观调控作用。 Fig1 主要介绍了小鼠原肠胚的表观遗传表达谱。热图表明外胚层、中胚层、中内胚层和胚外谱系的发育过程中差...

2.circular color系统：可以控制色调,亮度和饱和度 hls色彩，是RGB值的简单转换。

seaborn中实现scatterplot的主要参数 seaborn.catplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, row=None, col=None, col_wrap=None, order=None, hue_order=None, row_order=None, ...

做单细胞测序的时候，我们往往用到不同时期或者不同测序平台的数据,即使是同样的细胞类型，也可能完全不能聚类到一个类群中，如下所示，这两个数据是不同时期做的同一个细胞，几乎没有交集，因此，我们分析的时候需要去除批次效应...

seaborn.violinplot基本参数为： violinplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, order=None, hue_order=None, bw='scott', cut=2, scale='area', scale_hue=True, gridsize=...

计算一下所有细胞的counts分布情况，发现counts差距比较大，因此需要normalize