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划重点|ATAC的peak shift需要这样做

ATAC使用Tn5转座酶来完成文库的构建工作,Tn5转座酶在连接adapter序列时,会存在9bp的gap,如下图所示

2020-05-07
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SpringMVC集成redis cluster集群模式

1、cluster相对于哨兵模式是去中心化的,它的每个节点都存储了其它集群的信息,因此每个节点都可以做为集群的中心,容错能力强,具有更高的可用性和在线扩容能力。...

2020-04-12
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scRNA-seq数据处理—demultiplexing

根据使用的protocol和完整pipeline中的的特定pipeline,demultiplexing的方式不同。我们所知道的最灵活的demultiplexing pipeline是zUMI,它可用于demultiplexing和大多数基于UMI的protocol的比对。对于Smartseq2或其他p...

2020-03-27
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植物长链非编码RNA(lncRNA)鉴定实例(拟南芥数据)

参考资料里用到的是草莓的数据,我这里换成拟南芥的转录组测序数据 对应论文的数据实验组和对照组分别三个生物学重复,为了减小数据量和缩短计算时间,我这里只下载两个...

2020-03-19
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新生:Jenkins Pipeline基础语法篇(PPT)

部分内容来自站点:https://zeyangli.github.io/

2019-12-24
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Quantopian 入门系列二 - 流水线 (上)

在上贴〖Quantopian 系列一〗我们初探了的流水线(pipeline),本帖我们就把它揉碎了讲。

2019-11-28
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Jenkins项目、视图、插件管理

1. 项目管理1.1 命名规范业务名称-应用名称-应用类型_环境类型:cxy-wlck-ui_TEST, 只有命名规范才方便管理项目。1.2 新建项目设置构建历史 选择参数化构建 设置构建...

2019-10-18
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基于RASA的task-orient对话系统解析(一)

由于换工作以及家里的事,很久没有写东西了。最近因为工作内容,需要做任务型对话系统的相关研究和开发。趁此机会,总结一下rasa框架的基本内容,包括基本架构,代码级别的分析,以及使用上的一些tips。需要注意,本文不会详细描述...

2019-08-28
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一份程序猿单词列表(updating)

以下单词是个人平时阅读英文文档时遇到的一些“生”单词,该文档将持续更新,可以持续关注https://github.com/hylinux1024/word-list-for-programmer

2019-07-30
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从上到下的系统架构分析方法 - Intel PMU

现代 CPU 大多具有性能监控单元(Performance Monitoring Unit, PMU),用于统计系统中发生的特定硬件事件,例如缓存未命中(Cache Miss)或者分支预测错误(Branch Misprediction)等。同时,多个事件可以结合计算出一些高级指标,例如...

2019-06-04
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