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一、实验方案设计二、高分文献解析三、分子生物学技术四、细胞生物学技术五、转录组、代谢组、蛋白组测序六、生物医学实验方法PDF汇总

2019-05-23
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WGCNA:加权基因共表达网络分析

加权基因表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA),又叫权重基因共表达网络分析,其根本思想是根据基因表达模式的不同,挖掘出相似表达模式的基因,定义为模块(module)的一种算法。具有相似表达模式...

2019-05-20
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RNA-SEQ

跑完一个RNA-SEQ项目,下意识的看了看bam文件大小,还有最后的文库统计情况,发现非常的 诡异,首先是bam文件大小就很奇特:

2019-05-13
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批量COX回归生存分析图,指定挑选lncRNA基因,森林图,ROC曲线打包给你

(点评:其实也可以是突变与否的信息,或者其它组学信息,生存分析重点是研究分组,需要表达量,也是根据表达量高低进行分组而已)

na
2019-05-13
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手把手教你用R语言下载TCGA数据库:RTCGA

各位科研芝士的朋友,大家好,今天我们继续在TCGA R包的海洋里遨游,作为TCGA下载专业户,我们继续分享tcga好用的工具包,今天的主角是RTCGA。RTCGA这个包工作流程如下:...

na
2019-05-10
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Science: 小鼠肾脏单细胞转录组+突变分析揭示肾病潜在的细胞靶标

昨天Science文章背靠背揭示癌症中细胞感应氧气的新机制一文从表观水平分析了细胞中组蛋白修饰如何感知环境变化而发生不同的调控机制。

2019-05-09
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MATH值代表的肿瘤异质性在乳腺癌与生存关系不显著

但是今天要分享的文章Breast Cancer Research and Treatment February 2017 , 题目是:Clinical and molecular relevance of mutant-allele tumor heterogeneity in breast cancer 使用了另外一......

2019-05-08
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统计学10讲之示例数据

本来有statquest珠玉在前,我实在是提不起笔和勇气写统计学专题,但是最近直播单细胞转录组数据分析发现这系列知识点实在是太重要,而我的习惯是,讲不清楚的知识点不认为自己掌握了,所以还是尝试着介绍一波。...

2019-05-08
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R语言之生信(11)五分钟学会用R语言构建ceRNA网络

microRNA作为一种重要的调控因子,是长短约22nt的短链RNA,能够通过抑制目的基因的翻译或降解目的基因,从而反向调节目的基因的表达。而实际调控过程中不仅仅是简单的microRNA-mRNA的沉默机制,还有更为复杂的调控网络,一些非...

2019-05-07
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