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Nature系列 | 整合单细胞转录组学和质谱流式确定类风湿性关节炎滑膜组织中的炎症细胞状态 | 详细解读

To define the cell populations that drive joint inflammation in rheumatoid arthritis (RA), we applied single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), mass cytometry, bu...

2019-06-05
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3_0_4 要理解并会用的几个脚本

随便找几个文件进行练习,只是为了说明问题,这些其实是RNA-seq数据,但无所谓,只是看脚本的处理 有以下几个文件

2019-06-04
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一日一技:不等长度列表的同时迭代

有两个列表 [1,2,3]和 ['a','b','c'],当我们想对他们同时迭代的时候,可以这样写:

2019-06-03
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一文解决大量基因的生存分析并作图

这两篇纯生信文章都是对单个基因或者所有单个marker做生存分析,目的是找到其中能够影响患者生存的marker或者基因(包括miRNA,lncRNA,mRNA等等)。这也是目前非常常见的筛选基因或者marker的方法。...

2019-06-01
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R语言新神器visdat包(一行代码看穿整个数据集)

通过经典的airquality数据集(其中包含有关1973年5月至9月纽约每日空气质量测量的信息)展示vis_dat()的功能。

2019-05-31
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Pandas-8. 重建索引

以上代码df1应该是3列10行,之后和df2对齐。 对齐操作列名应该匹配,无法对齐的列整列置为NAN。

2019-05-29
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R语言︱逻辑运算

R软件包含两个逻辑值,TRUE和FALSE。在其他编程语言中也称为布尔值(Boolean values)。布尔向量就是充满着逻辑值的逻辑向量。那么有如何的应用呢?

2019-05-28
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R语言︱缺失值处理

1、输出数据格式不同。is.na按照数据框格式形成一个(FALSE,FALSE,TURE)列,而complete.cases形成是一个数列向量,不再是按照数据框格式;

2019-05-28
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手把手教你用R语言下载TCGA数据库:RTCGA

该包实际上一系列根据数据类型分离的包,相当于要先下载这些离线数据R包之后再直接从离线数据包里面获取TCGA的所有数据。具体网址:

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2019-05-23
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miRTissue:一款miRNA-target-protein相互关系分析的神器

microRNAs (miRNAs)是基因表达的主要调控因子,有多项研究表明其通过与靶基因的相互作用参与疾病的生理和病理过程。在癌症中,miRNAs的一个重要作用是:它们可以作为“癌基因”或“抑癌基因”发挥作用,而这种相悖的作用取决...

2019-05-23
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