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R语言实现sequence logos绘制

我们前面讲过在python中如何实现测序图标(sequence logos)的绘制。今天给大家介绍一个在R语言中实现DNA,RNA以及氨基酸的logos绘制的R包motifStack。首先我们看下包的安装,主要是通过bioconductor进行安装,具体的代码不再...

2019-09-08
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分享文章:重新启程之Excel图表

上一篇,预告了下面这张图,请大家可以思考,这张图是怎么做出来的?**(不用怀疑,这的确是用Excel做的。)

2019-08-27
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全基因组测序的7个概念(学徒翻译)

原文链接:https://www.healio.com/hematology-oncology/learn-genomics/whole-genome-sequencing/overview-key-objectives>什么是真核细胞  细胞构成了人类生命的基本框架,是人类生活的基本组成部分。人体由数万亿个...

na
2019-08-22
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反转录PCR

反转录PCR(Reverse Transcription,RT-PCR)又称为逆转录PCR。其原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基...

2019-08-07
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R语言实现时序RNA-seq分析

提到RNA-Seq差异表达分析,大家首先想到的癌症与癌旁组织的表达差异分析。然而如果想探究不同时间下对目标产生的影响,此方法便失去作用,那么便出现了时序RNA-seq。今天我们为大家介绍一个可以做时序RNA-seq分析的R包maSi...

2019-07-31
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基本概念RNA是什么?cDNA是什么?内参是什么? real time PCR 是什么?

1、基本概念RNA是什么?cDNA是什么?内参是什么? real time PCR 是什么?

2019-07-25
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SAP IDOC 通过采购订单输出消息生成销售订单

在网络上看到一篇类似的公众号文章,叫《通过IDoc逐步指导PO&SO集成》,个人觉得整个配置过程中还是少了一些重点配置,也少了说明整个功能的核心逻辑,那么,趁着这个机会,就让我来完整说明一下吧!...

2019-07-19
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手把手学习TCGA数据库:SNP突变分析第一期

SNP(single nucleotide polymorphism),单核苷酸多态性,在基因组上由单个核苷酸变异形成的遗传标记,一般指变异频率大于1%的单核苷酸变异。

na
2019-06-17
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6 RNA-seq数据和WXS数据分组及改名

下一步,需要把RNA-seq(448个样本)和WXS(279个样本)分开进行比对,所以首先要把他们分开,并重新命名 具体信息见总目录

2019-06-15
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RIsearch2简洁用法

1下载安装,设置环境变量cd biosoftwget https://rth.dk/resources/risearch/RIsearch-2.1.tar.gztar -xzvf RIsearch-2.1.tar.gzcd RIsearch-2.1less READMEless INSTALL加入环境变量...

2019-06-11
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