蛋白质是大多数药物的靶点,目前,通过将新的生化方法与基于质谱的蛋白质组学相结合,能够从全新的维度对疾病表型及其生物活性分子的调节机制进行剖析。最近,德国慕尼黑马克斯普朗克生化研究所(Max Planck Institute of Bioc...
上一篇文章里面简单学习了一下表达矩阵的提取,顺便探索了一下SummarizedExperiment对象。
很多人因为网络原因不能使用TCGAbiolinks这个神包下载TCGA的RNA-seq数据,只能通过浏览器访问GDC TCGA的官网进行下载,而下载后得到的是一个个文件夹,对于如何整理成一个表达矩阵也是很麻烦的。...
现在使用TCGAbiolinks下载转录组数据后,直接是一个SummarizedExperiment对象,这个对象非常重要且好用。因为里面直接包含了表达矩阵、样本信息、基因信息,可以非常方便的通过内置函数直接提取想要的数据,再也不用手扒了!!...