最新 最热

HARQ发展_harq技术

这里TX是发射端,RX是接收端,可以看得出来,从TX发送包S1,但RX解码失败,然后把接收到的包丢弃,反馈NACK给TX,接着TX继续发送包S1,第二次RX解码成功,然后反馈ACK给TX,TX接收到反馈后开始发送新的包S2....

2022-11-17
1

打造生物科技领域的“EDA”,智峪生科推出全生态蛋白计算设计平台

智峪生科全生态大分子计算设计平台“峪云ZCloud”横空出世,为生物科技打造基于人工智能的EDA工具。

2022-11-16
0

基于质谱的蛋白质组学在加速药物发现中的新角色

蛋白质是大多数药物的靶点,目前,通过将新的生化方法与基于质谱的蛋白质组学相结合,能够从全新的维度对疾病表型及其生物活性分子的调节机制进行剖析。最近,德国慕尼黑马克斯普朗克生化研究所(Max Planck Institute of Bioc...

na
2022-11-16
0

1行代码提取6种TCGA表达矩阵2.0版

之前写了一个脚本,可以让大家1行代码提取6种类型的表达矩阵以及对应的临床信息。但是很多人完全看不见注意事项或者根本看不懂,所以我决定改动一下。...

2022-11-15
1

可能是最适合初学者的TCGA官网下载和表达矩阵整理教程

从打开网址开始教你一步一步的下载TCGA的数据,图文并茂,真的是详细的不能再详细了!

2022-11-15
1

新版TCGA数据库不同癌种的组学数据合并

很多文章对于TCGA中的一些癌症都是联合分析的,比如TCGA-COAD和TCGA-READ,首先是它们的疾病特点和治疗方式存在很多相似之处,同时这样做也可以增大样本量。...

2022-11-15
0

新版TCGAbiolinks包学习:差异分析

上一篇文章里面简单学习了一下表达矩阵的提取,顺便探索了一下SummarizedExperiment对象。

2022-11-15
1

手动下载的TCGA数据也是可以用TCGAbiolinks包整理的

很多人因为网络原因不能使用TCGAbiolinks这个神包下载TCGA的RNA-seq数据,只能通过浏览器访问GDC TCGA的官网进行下载,而下载后得到的是一个个文件夹,对于如何整理成一个表达矩阵也是很麻烦的。...

2022-11-15
1

新版TCGAbiolinks包学习:表达矩阵提取(mRNA/lncRNA/counts/tpm/fpkm)

现在使用TCGAbiolinks下载转录组数据后,直接是一个SummarizedExperiment对象,这个对象非常重要且好用。因为里面直接包含了表达矩阵、样本信息、基因信息,可以非常方便的通过内置函数直接提取想要的数据,再也不用手扒了!!...

na
2022-11-15
0

新版TCGAbiolinks包学习:批量下载数据

TCGAbiolinks不仅是数据下载,它能访问、下载全部的TCGA数据(除了受限制的),用它下载的数据是最新最全的!这和直接去GDC官网,使用网页下载的方式是一样的。...

2022-11-15
1