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使用bedtools的getfasta功能来获取指定坐标上下游的序列

前些天给学徒演示了猪狗的参考基因组构建索引 就顺便布置了作业,有意思的是她下载的时候,在两个参考基因组文件里面犹豫不决:

2020-02-20
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根据感兴趣基因看肝癌免疫微环境的T细胞亚群差异

在单细胞水平探究肝癌免疫微环境研究最早而且出名的就是北大张泽明教授团队发表在Cell. 2017 Jun 的文章:Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing.,他们测序策略是:Here...

2020-02-20
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实时远程医学影像服务质量保障与网络优化

华大影像团队成立的意义:通过集成机器人技术、实时远程控制技术及超声影像技术,解决偏远地区、基层医疗机构缺少超声医生、以及现有医生超负荷工作的现状;打破传统超声诊疗方式的局限,克服时空的障碍,改善医疗资源分布不均...

2020-02-20
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手把手教你用AI画冠状病毒

近期有关于冠状病毒的信息很多,相关学术论文数目也在不断增加。为了让论文好看一点,今天我们来使用AI画一个冠状病毒,练习练习AI的画图技巧。

2020-02-19
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两个基因突变让虫子续命5倍,南大与美国MDI科学家发现延长寿命新方法

秀丽隐杆线虫是第一种完成全基因组测序的多细生物,也是唯一完成神经元连接测定的生物。

na
2020-02-12
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Python数据分析--Pandas知识

利用drop_duplicates()函数删除数据表中重复多余的记录, 比如删除重复多余的ID.

2020-01-19
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一文重复一篇四分SCI------基于TCGA和geo的circRNA研究(2)

环状RNA(circRNAs)是广泛表达的无5′端和3′端的RNA,形成共价封闭的RNA环。在真核生物中,circRNAs最常通过反褶叠产生,在反褶叠过程中,剪接的RNA的5'和3'端共价连接形成包含外显子和/或内含子序列的封闭RNA分子。...

2020-01-15
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GNS3

苦于没有实际坏境来操作,GNS3无疑就是学习思科网络的最好工具,Cisco Packet Tracer功能太少,只能用来CCNA的简单实验,而GNS3里面的路由器本来是不全面的,道搜索了很久才找到C1700,2600,2691,3600,3700,7200路由器镜像。...

2020-01-13
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LTE珍藏笔记(上)

本文为作者独家LTE珍藏笔记,属于纯理论介绍,特别适合突击考试使用,敬请各位客官享用,更多干货敬请关注公众号。

2019-12-27
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北大课题组报道单氨基酸精度绘制蛋白质功能图谱新方法

2019年12月16日,魏文胜课题组在Genome Biology杂志在线发表题为“PASTMUS: mapping functional elements at single amino acid resolution in human cells”的研究论文。

2019-12-25
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