最新 最热

单细胞测序基础知识

有限稀释技术(Limiting dilution technique)是利用移液管稀释分离细胞,这种方法的主要缺点是效率低下,成功率20%左右。

2020-03-27
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单细胞RNA测序综述汇总—肿瘤研究的新工具

各种形式的肿瘤内异质性和复杂性会影响抗肿瘤治疗的疗效,导致治疗耐药性和转移。而近年来兴起的单细胞测序技术,结合数据整合方法的创新,使得精细理解肿瘤及肿瘤微环境中细胞间的相互作用,表征疾病进展过程中肿瘤内部结构...

na
2020-03-27
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单细胞转录组技术梳理(一)

谈起单细胞转录组测序就不得不提到北京大学汤富酬教授,2009年,汤富酬老师在博士后期间发表了世界上第一篇单细胞mRNA测序的文章“mRNA-Seq whole-transcriptome analysis of a single cell”,自此正式拉开了单细胞转录...

na
2020-03-27
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单细胞转录组技术梳理(二)

在这之后,许多更灵敏、更准确的单细胞转录组技术如雨后春笋般相继被开发出来。今天继续来回顾一下2011年的单细胞转录组测序技术 STRT(Single-cell tagged reverse transcription )。文章是:Characterization of the sing...

2020-03-27
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植物长链非编码RNA(lncRNA)鉴定实例(拟南芥数据)

参考资料里用到的是草莓的数据,我这里换成拟南芥的转录组测序数据 对应论文的数据实验组和对照组分别三个生物学重复,为了减小数据量和缩短计算时间,我这里只下载两个...

2020-03-19
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Attention基本公式及其变种

Score fucntion本质上是在求一种匹配度(相似度),Aligment function是把所有位置上的权值归一化,使其相加等于1(softmax正是这种功能),最后的加权求和是为了使得经过LSTM/RNN encode之后的文本与权值关联起来得到加权的中...

2020-03-18
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为什么一个python报错不影响hisat2的运行呢

但是使用它把测序数据fastq文件比对到参考基因组的fasta文件的时候,发现运行日志里面有一个很有趣的报错:

2020-03-17
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1分钟教你玩转组合图表

在日常工作中,有时候单一的图表类型无法满足多维度的数据展示,这时候就要考虑使用组合图表。

2020-03-06
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癌细胞“绑架”神经元帮自己壮大,科学家破译癌细胞分子机制 | 最新Nature封面

简单讲,就是癌细胞能发射信号,促成一种肾上腺素神经元生长,这些神经元在癌组织中增殖,就等于在帮癌症壮大。

na
2020-02-25
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新冠肺炎病毒肺炎还会伤肝!复旦最新研究指出:应对患者进行肝功能异常特别护理

但最新的研究表明,这种肝异常可能不是由于病毒对肝细胞造成了损伤,而是由胆管细胞功能障碍和药物诱导、全身性炎症反应等其他原因引起。

na
2020-02-21
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