这是ST团队进行的一个示例实验。在一个单独的实验中揭示所有具有空间分辨率的小鼠大脑mRNA。

我不知道哪个研究团队会率先开发出来融合基因流程，不过今天刷Twitter看到了Nathan Castro-Pacheco is presenting STARsolo-Quant, a method for quantifying isoform expression in scRNA-seq data的新闻，是美国生......

本文为Nature在今年年初的时候通过大数据分析、整理多位业内大佬采访稿所发布的报告，具有一定前瞻性，值得一读。

FateID还提供伪时间基因表达变化的可视化和分析功能。为此，可以提取具有朝向目标簇的命运偏差的细胞。principal curve 分析以伪时间顺序返回沿着分化轨迹的所有细胞。例如，可以通过以下命令提取以伪时间顺序向簇6具有...

本来想看这篇文章 A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data.一种通用、灵活的单细胞转录组数据降维方法，ZINB-WaVE。它使用零膨胀负二项式模型，能够解释dropout、超表达和...

今天介绍的是一篇单细胞综述，发表于2013年的Nature reviews genetics ，预测了如今单细胞技术的火热。文章题目是：Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science。...

作者的亚群信息都在Table S2. Human lung cell cluster identities and their abundances in each dataset.分别是：

而且后面关于器官图谱的单细胞文章，或多或少会引用他们的数据，包括2019年8月发布的广西医科大学基因组与个体化医学研究中心莫曾南教授课题组的Bladders单细胞研究，如下：...

第一个是2018年2月 发表在Cell（《细胞》）杂志的，浙江大学郭国骥团队的研究成果。其课题组自主开发了一套完全国产化的Microwell-seq高通量单细胞测序平台，对来自小白鼠近50种器官组织的40余万个细胞进行了系统性的单细胞...

Seurat 3.X版本能够整合scRNA-seq和scATAC-seq, 主要体现在：