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单细胞测序揭示皮肤伤口中成纤维细胞的异质性

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目:...

2020-03-30
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哺乳动物胚胎发生过程的分子记录

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长。...

na
2020-03-30
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小鼠原肠胚形成和早期器官发生的单细胞分子图谱

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长。...

2020-03-30
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单细胞转录多样性是发育潜能的一个标志

单细胞RNA测序(scRNA-seq)是重建细胞分化轨迹的有力方法。然而,同时推断分化的状态与方向是一项具有挑战性的工作。今天分享的文章于2020年1月发表在期刊Science上,文章作者利用转录多样性的度量方法来开发了计算框架(Cyto...

na
2020-03-30
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SCENIC | 以single-cell RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能聚类

目前单细胞转录组领域用的比较多的细胞聚类方法大多是直接从基因表达矩阵推断,但是对于多样本合并分析,很多情况下会出现难以解决的批次效应,例如:...

2020-03-30
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过滤不合格细胞和基因(数据质控很重要)

现在一起看看拿到表达矩阵后有一个很重要的质控过程,就是根据一些阈值来过滤不合格细胞和基因。、细胞的不合格很容易理解, 可能是那个细胞检测到的基因数量太少,或者太多,也许是那个细胞的文库大小异常,都是需要谨慎考虑...

2020-03-30
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乳腺癌高突变负荷小鼠模型中检查点抑制剂调节作用的研究

今天带来的这篇文章2019年11月发表在期刊Cell上,题为:B Cells and T Follicular Helper Cells Mediate Response to Checkpoint Inhibitors in High Mutation Burden Mouse Models of Breast Ca......

2020-03-30
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单细胞遗传筛查确定上皮-间充质转化连续体中的调控点

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步。不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长。...

2020-03-30
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发育谱系推断及可视化

细胞的变化是连续性的,它们从一个时间到另一个时间的变化轨迹是非常需要了解的,这也就是为何谱系推断这么重要的原因。

2020-03-30
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同一细胞中转录组和染色质高通量测序联合分析

每个人的时间精力有限,必须优先阅读相关文献,开设这个栏目也是希望为大家推荐高质量的单细胞相关文献。如果大家对单细胞转录组感兴趣可以关注一下,哪怕每天只学一点点,积土成山,积水成渊。...

2020-03-30
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