组装得到基因组的序列只是开展基因组研究的第一步，基因的结构是基因组后续功能研究的基石。在NCBI中，除了提供基因组序列外，还提供了基因结构的信息，采用的就是GFF格式。human示例如下...

在NGS数据分析中，常常需要对fasta/fastq文件进行一些处理，fastx_toolkit是一款综合性的工具，提供了很多有用的功能，能够简单方便的处理序列文件。官网如下...

核糖体RNA, 缩写为rRNA, 是细胞内含量最多的一类RNA, 能够与蛋白质结合形成核糖体，完成氨基酸的合成。rRNA分子量较大，通常利用沉降系数来区分不同类别的rRNA，沉降系数越大，分子量越大。...

tRNAscan是一款tRNA预测工具，支持不同类型基因组的tRNA预测，包括以下四种类型

DiffBind是一个用于peak差异分析的R包，源代码保存在Bioconductor上，链接如下

motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能，在转录因子的chip_seq, m6A_seq等落雨都有广泛应用，之前也写了很多的文章来介绍motif

除了展示GTF, bed等常规格式的基因结构信息，IGV还可以展示RNA的二级结构，在下面这篇文章中，就是通过IGV的这一功能来直观的展示RNA二级结构

名字很长，翻译为转座酶可及的染色质区域的高通量测序。在这个冗长的名字中，高通量测序我们一点都不陌生，NGS二代测序已经发展了这么多年，各种组学技术，比如WES, WGS, RNA_seq等等，应用非常广泛。那么”转座酶可及的染色质区...

近日，四川大学华西医院卢铀教授团队公布了4年前开展的一项基因编辑临床试验结果：CRISPR-Cas9编辑的T细胞在临床上治疗晚期肺癌等疾病是安全可行的。目前，该论文已经发布在4月27日的《Nature》上。...

单细胞转录组学已改变了我们认识细胞状态的能力，但对生物学的深入了解，整合多组学数据集以更好地理解细胞身份和功能。该文章开发了一个 一起“锚定”各种数据集的策略，使我们能够整合单细胞数据，不仅跨scRNA-seq技术，而且...