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Nucleic Acids Res. | scHumanNet:用于研究疾病基因细胞类型特异性的单细胞网络分析平台

本文介绍由哈佛医学院的Martin Hemberg和韩国延世大学生命科学与生物技术学院生物技术系的Insuk Lee共同通讯发表在Nucleic Acids Research的研究成果:单细胞生物学面临的一个主要挑战是识别细胞类型特异性基因功能,这...

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2022-11-28
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Nat. Commun.| 通过将异质数据集投射到一个共同的细胞嵌入空间进行在线单细胞数据整合

本文介绍由清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室、北京结构生物学高级创新中心和生物结构前沿研究中心、合成与系统生物学研究中心的Qiangfeng Cliff Zhang通讯发表在 Nature Communications 的研究成果:作...

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2022-11-28
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Bioinformatics | 注释scRNA-seq数据时自动识别新细胞

本文介绍由美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心生物统计学系的Ziyi Li和Kim-Anh Do共同通讯发表在 Bioinformatics 的研究成果:为了更好地注释scRNA-seq 数据,发现新的细胞类型,作者开发了一种简单而有效的方法,结合自动编...

2022-11-28
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Nat. Comm. | 使用Tensor-cell2cell对细胞通讯进行环境感知去卷积

本文介绍由美国加州大学圣地亚哥分校生物工程系Nathan E. Lewis通讯发表在 Nature Communications 的研究成果:作者介绍了Tensor-cell2cell,这是一种基于张量分解的无监督方法,它通过同时说明细胞的多个阶段、状态或位置...

2022-11-28
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M2-TAM细胞相关biomarker构建新的预后signature揭示免疫景观并在肝癌中筛选药物

这篇文章的分析主要分为两个部分(1)结合传统转录组数据与单细胞转录组数据鉴定出与HCC M2-TAM高度相关的signature;(2)使用多种分析角度signature的重要意义,包括预后准确性分析、泛化能力验证、指导药物发现等方面。...

2022-11-24
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单细胞分析揭示了ZNF683在多发性骨髓瘤的NK细胞耗竭中的关键作用

问题:在多发性骨髓瘤(MM)中 NK 细胞的细胞毒性降低。潜在的分子机制尚不清楚。

2022-11-24
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SCIENCE | 肿瘤中 RNA 结合蛋白 FMRP 的异常高表达介导免疫逃避

自然过度表达 FMRP 的癌细胞具有侵袭性和转移性,FMRP 在发育中的神经元中表达缺失会导致认知缺陷。我们研究了 FMRP 在人类肿瘤中的表达,进一步评估了其在小鼠癌症模型中的肿瘤促进功能,并评估了其与人类癌症患者预后的...

na
2022-11-24
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ASML公布扩产计划:EUV光刻机90台/年,DUV光刻机600台/年

11月11日消息,光刻机大厂ASML在其位于荷兰费尔德霍芬的总部召开了投资者日会议,同时也通过在线形式向投资者介绍了其对于未来公司前景的看法。

na
2022-11-22
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论独立思考

从金字塔看思考的三个层次,首先塔底是经验,大多数人都是根据自己直接经验或者从别人那里得到的信息做判断;其实是对个体化经验的解释,有时以偏概全,有时基于集体或文化的思想,基本都有一定的逻辑及理论支撑,但并不可靠;最后是...

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2022-11-22
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SMBus学习记录

SMBus 是 System Management Bus 的缩写,译为系统管理总线,SMBus是一种二线制串行总线,1996年第一版规范开始商用。它大部分基于I2C总线规范。

2022-11-18
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