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「R」使用NMF包绘制热图

学习文档: https://cran.r-project.org/web/packages/NMF/vignettes/heatmaps.pdf

2020-07-03
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「R」数据操作(一)

数据框的本质是一个由向量构成的列表,由于列长度相同,所以可以当做矩阵进行访问和操作。比如选择满足特定条件的行,使用[]符号,第一个参数提供一个逻辑向量,第二个参数留空。...

2020-07-02
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实习期完成,无图像对和域标签,博士小哥实现完全无监督的图像转换

我们都知道,最近出现的各种图像到图像转换模型都至少使用图像级(即输入 - 输出对)或集合级(即域标签)监督中的一种。但实际上,即使是集合级的监督也可能成为数据收集过程中严重的瓶颈。...

2020-06-29
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学学这篇免疫浸润文章和作者一样发5+分

A novel immune-related genes prognosis biomarker for melanoma- associated with tumor microenvironment肿瘤微环境相关黑色素瘤的一种新的免疫相关基因预测生物标志物

na
2020-06-28
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这么热的circRNA如何结合生信发文章?

The Circular RNA Landscape of Non-Small Cell Lung Cancer Cells

na
2020-06-28
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文章拆解:基因组+免疫浸润+干预=6分SCI?

Genetic and Immune Changes Associated with Disease Progression under the Pressure of Oncolytic Therapy in A Neuroblastoma Outlier Patient

2020-06-28
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拥有这个R包,只需三步帮你找到差异表达基因

目前,利用大量的微阵列或RNA-Seq技术来探索不同条件(例如治疗或疾病)之间基因表达的差异是研究疾病的最简单方法。但是,如何快速的从测序得到的“海量”的基因集群中发现差异表达的基因(DEGs)仍然是一项非常重要的任务。...

2020-06-24
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哇!单细胞测序-配体受体互作分析原来可以这么简单又高大上!

单细胞转录组测序发展至今,我们发现许多文章的最后一部分都会落到配受体结合,可是如何挑配受体,哪些基因可能是配受体,我一脸懵逼。。。

2020-06-16
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为什么自己的实验数据与别人不一致?究竟是谁在“说谎”?

在检查了实验流程、理论推导后,始终找不到原因。在几乎脱发时,开始了灵魂拷问:我是谁?发生了什么?我为什么要做科研?

na
2020-06-11
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去rRNA可以解决GC含量双峰的右峰

前些天我在生信技能树提出来了一个转录组数据分析的疑难杂症:RNA-seq的fastq文件里面为什么有gc含量的双峰,就是fastq测序数据质量控制的时候发现了GC含量的双峰,然后我简单分析了那些高重复的reads,发现一些是BCA文库,一...

2020-06-11
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